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Enregistrement W2088574912 · doi:10.1111/j.1537-2995.2006.00787.x

Integration of nucleic acid amplification test results into hepatitis C virus supplemental serologic testing algorithms: implications for donor counseling and revision of existing algorithms

2006· article· en· W2088574912 sur OpenAlexaff
Steven Kleinman, Susan L. Stramer, Jaye P. Brodsky, Sally Caglioti, Michael P. Busch

Notice bibliographique

RevueTransfusion · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNatNucleic acid testAlgorithmMedicineHepatitis C virusSerologyImmunoassayVirologyHepatitis CDonationImmunologyAntibodyVirusInternal medicineComputer scienceCoronavirus disease 2019 (COVID-19)DiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The routine use of hepatitis C virus (HCV) nucleic acid amplification testing (NAT) donor screening assays has provided an opportunity for revision of the current HCV supplemental testing algorithm, which requires that recombinant immunoblot assay (RIBA) be performed on every HCV enzyme immunoassay (EIA)-repeat-reactive donation. The FDA has approved variance requests to use a new algorithm that eliminates the need to perform RIBA when HCV NAT results are reactive. Data are provided in support of this new algorithm. STUDY DESIGN AND METHODS: HCV EIA (including signal-to-cutoff optical density ratio), RIBA, and NAT data were compiled from 33.2 million donations screened over an approximately 4-year period by the American Red Cross and Blood Systems Laboratories. Further, donations having specific combinations of HCV EIA, RIBA, and minipool (MP) NAT results were evaluated, with more sensitive individual-donation (ID) NAT, to construct improved counseling messages for donors. RESULTS: Of 47,041 EIA-repeat-reactive donations, 49.3 percent were RIBA-positive, 17.1 percent RIBA-indeterminate, and 33.5 percent RIBA-negative. NAT-reactive rates were 79.2, 2.5, and 0.18 percent for RIBA-positive, -indeterminate, and -negative donations, respectively. The new algorithm classified an additional 1 percent of donations as HCV-infected while at the same time detecting all infections classified as HCV-infected under the current algorithm. An additional 2.4 percent of RIBA-positive, MP NAT-nonreactive donations were reactive when a frozen-thawed aliquot was retested by ID NAT. CONCLUSION: Integrating HCV NAT results with RIBA results for purposes of donor notification allows more appropriate counseling messages to be given to EIA-repeat-reactive donors. The new HCV supplemental algorithm is an acceptable alternative to the current algorithm because it provides equivalent or superior accuracy in formulating donor counseling messages and may also result in reduced costs and more timely notification of infected donors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,297
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,361
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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