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Enregistrement W2088585163 · doi:10.1039/b905580k

Phosphoproteomics—finally fulfilling the promise?

2009· review· en· W2088585163 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular BioSystems · 2009
Typereview
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced Proteomics Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesUniversity of British ColumbiaRoyal Society of ChemistryRoyal Society
Mots-clésPhosphoproteomicsPhosphopeptideProtein phosphorylationPhosphorylationSignal transductionComputational biologyPosttranslational modificationBiologyProteomicsPhosphoserineProteomeBiochemistrySerineChemistryCell biologyProtein kinase A

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Networks of protein-protein and protein-metabolite interactions are commonly found in biological systems where signals must be passed from one location or component within a cell to another, such as from a receptor on the plasma membrane to a transcription factor in the nucleus. Regulation of such networks, or signal transduction pathways, is often achieved by transient, reversible modification of the components involved. Several types of post-translational modifications of proteins are employed in signal transduction including ubiquitylation of lysines and palmitoylation of cysteines, but by far the best appreciated and apparently the most important involves phosphorylation of serine, threonine and tyrosine residues. Whilst protein phosphorylation has long been recognized as functionally important, low stoichiometry has ultimately impeded global analyses (phosphoproteomics). Recent developments in the application of metal oxide chromatography and advanced mass spectrometric techniques have enabled phosphoproteomics to move beyond mere proof-of-principle experiments, to the stage where it can successfully address complex biological questions. Here we cover the development of phosphopeptide/protein analysis by mass spectrometry and the various techniques used to enrich phosphopeptides/proteins. We also speculate on the future of phosphoproteomic research, now that the goal of generating global phosphoproteomic datasets has been realized.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,977
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle