MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2088738061 · doi:10.1186/1753-6561-3-s7-s1

Genetic Analysis Workshop 16: Strategies for genome-wide association study analyses

2009· article· en· W2088738061 sur OpenAlexaffabout
L. Adrienne Cupples, Joseph Beyene, Heike Bickeböller, E. Warwick Daw, M. Daniele Fallin, W. James Gauderman, Saurabh Ghosh, Ellen L. Goode, Elizabeth R. Hauser, Anthony L. Hinrichs, Jack W. Kent, Lisa J. Martin, María Martínez, Rosalind J. Neuman, Michael A. Province, Silke Szymczak, Marsha Wilcox, Andreas Ziegler, Jean W. MacCluer, Laura Almasy

Notice bibliographique

RevueBMC Proceedings · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesUniversity of Warwick
Mots-clésMedicineFamily medicineGenome-wide association studyAlternative medicinePathologyGeneticsSingle-nucleotide polymorphismGenotypeBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This supplement to BMC Proceedings contains the proceedings of Genetic Analysis Workshop (GAW) 16, which was held September 17-20, 2008, in St. Louis, Missouri, USA. Initiated in 1982, the GAWs are now held in even-numbered years with the purpose of evaluating strategies for detecting genetic effects of complex diseases, thought to be the result of the joint effects of environmental and genetic factors. Each GAW meeting begins with the distribution of datasets that those who attend the Workshop use for the purpose of developing and/or evaluating statistical methods. These datasets are jointly chosen for the next Workshop through a discussion of those attending the meeting and the GAW Advisory Committee. At most Workshops, GAW has included a set of simulated datasets, so that researchers can examine the behavior of statistical methods when knowing the answer. A primary goal of the Workshops is to focus discussion on specific topics of interest and areas of methodological concern. The datasets are generally available to any researcher who requests them. Each person who desires to attend the Workshops must participate in the evaluation of at least one of the distributed datasets, investigating novel approaches or comparing emerging and existing methods. Participants also include those who have provided the data or participate in the Workshop organization. More information about GAW, including details of upcoming Workshops, may be found at http://www.gaworkshop.org .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,097
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,129
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,097
Score d'incertitude au seuil0,514

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0970,129
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0060,004
Science ouverte0,0070,008
Intégrité de la recherche0,0050,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0820,036

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBMC ProceedingsMême sujetGenetic Associations and EpidemiologyTravaux en français237 207