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Enregistrement W2088822805 · doi:10.1523/jneurosci.4962-08.2010

The<i>N</i>-Glycanase<i>png-1</i>Acts to Limit Axon Branching during Organ Formation in Caenorhabditis elegans

2010· article· en· W2088822805 sur OpenAlexafffund
Nasrin Habibi-Babadi, Anna Su, Carlos Egydio de Carvalho, A. Colavita

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensHeart and Stroke FoundationUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésBiologyCaenorhabditis elegansCell biologyAxonEndoplasmic reticulumGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Peptide:N-glycanases (PNGases) are cytoplasmic de-N-glycosylation enzymes that have been shown in cultured cells to facilitate the degradation of misfolded glycoproteins during endoplasmic reticulum-associated degradation and in the processing of major histocompatibility complex class I antigens for proper cell-surface presentation. The gene encoding PNGase activity was initially described in budding yeast (Png1p) and shown to be highly conserved from yeast to humans, but physiological roles in higher organisms have not been elucidated. Here we describe peripheral nervous system defects associated with the first loss-of-function mutations in an animal PNGase. Mutations in png-1, the Caenorhabditis elegans PNGase ortholog, result in an increase in axon branching during morphogenesis of the vulval egg-laying organ and egg-laying behavior changes. Neuronal defects include an increase in the branched morphology of the VC4 and VC5 egg-laying neurons as well as inappropriate branches from axons that run adjacent to the vulva but would normally remain unbranched. We show that png-1 is widely expressed and can act from both neurons and epithelial cells to restrict axon branching. A deletion allele of the DNA repair gene rad-23, orthologs of which are known to physically interact with PNGases in yeast and mammals, displays similar axon branching defects and genetic interactions with png-1. In summary, our analysis reveals a novel developmental role for a PNGase and Rad-23 in the regulation of neuronal branching during organ innervation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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