Thymic stromal lymphopoietin: an immune cytokine gene associated with the metabolic syndrome and blood pressure in severe obesity
Notice bibliographique
Résumé
A previous expression profiling of VAT (visceral adipose tissue) revealed that the TSLP (thymic stromal lymphopoietin) gene was less expressed in severely obese men with (n=7) compared with without (n=7) the MetS (metabolic syndrome). We hypothesized that TSLP SNPs (single nucleotide polymorphisms) are associated with TSLP gene expression in VAT and with MetS phenotypes. Following validation of lower TSLP expression (P=0.003) in VAT of severely obese men and women with (n=70) compared with without (n=60) the MetS, a detailed genetic investigation was performed at the TSLP locus by sequencing its promoter, exons and intron-exon splicing boundaries using DNA of 25 severely obese subjects. Five tagging SNPs were genotyped in the 130 subjects from the expression analysis to test whether these SNPs contributed to TSLP expression variability (ANOVAs) and then genotyped in two independent samples of severely obese men (total, n=389) and women (total, n=894). In a sex-stratified multistage experimental design, ANOVAs were performed to test whether tagging SNPs were associated with MetS components treated as continuous variables. We observed that the non-coding SNP rs2289277 was associated with TSLP mRNA abundance (P=0.04), as well as with SBP [systolic BP (blood pressure)] (P=0.004) and DBP (diastolic BP) (P=0.0003) in men when adjusting for age, waist circumference, smoking and medication treating hypertension. These novel observations suggest that TSLP expression in VAT may partly explain the inter-individual variability for metabolic impairments in the presence of obesity and that specific SNPs (rs2289277 and/or correlating SNPs) may influence TSLP gene expression as well as BP in obese men.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».