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Enregistrement W2088832657 · doi:10.1002/mds.21895

Large deletions account for an increasing number of mutations in <i>SGCE</i>

2007· article· en· W2088832657 sur OpenAlexaff
Fabin Han, Lemuel Racacho, Howard H. Yang, Tara Read, Oksana Suchowersky, Anthony E. Lang, David A. Grimes, Dennis E. Bulman

Notice bibliographique

RevueMovement Disorders · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensUniversity Health NetworkOntario Brain InstituteUniversity of CalgaryToronto Western HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneticsBiologyMutationProbandDenaturing high performance liquid chromatographyGeneMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Myoclonus-dystonia (M-D) (MIM 159900) is a rare "dystonia plus" syndrome, characterized by rapid myoclonic jerks, predominantly in the neck and upper limbs, in combination with dystonia. Mutations in the gene epsilon-sarcoglycan (SGCE) are known to be responsible for approximately one-third of cases. We screened 21 probands diagnosed with M-D for large deletions who were mutation negative as determined by PCR-direct sequencing. Multiplex PCR and quantification of PCR products was performed using a modified application of denaturing high performance liquid chromatography (dHPLC). We have identified two novel large multiexonic deletions of SGCE, which were confirmed by amplifying and sequencing the deletion breakpoints. Five other families were found to harbor small mutations identified by direct sequencing. Analysis of the region surrounding the deletions demonstrates that both deletions are the result of nonhomologous recombination with homologous end joining. This is only the second report of intragenic deletions with SGCE and it highlights the need to include exonic copy number variation when performing mutational analysis of SGCE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,502
Score d'incertitude au seuil0,499

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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