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Enregistrement W2088995524 · doi:10.1074/jbc.m110.109843

A Role for Sp1 in Transcriptional Regulation of Phosphatidylethanolamine N-Methyltransferase in Liver and 3T3-L1 Adipocytes

2010· article· en· W2088995524 sur OpenAlexafffund
Laura Cole, Dennis E. Vance

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFondation pour la Recherche Médicale
Mots-clésChromatin immunoprecipitationBiologyMolecular biologyTranscriptional regulationPhosphatidylethanolamine3T3-L1Sp1 transcription factorPromoterTranscription factorCell biologyPhosphatidylcholineGene expressionBiochemistryAdipocyteGeneAdipose tissuePhospholipid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phosphatidylcholine is made in all nucleated mammalian cells via the CDP-choline pathway. Another major pathway for phosphatidylcholine biosynthesis in liver is catalyzed by phosphatidylethanolamine N-methyltransferase (PEMT). We have now identified 3T3-L1 adipocytes as a cell culture model that expresses PEMT endogenously. We have found that PEMT mRNA and protein levels increased dramatically in 3T3-L1 cells upon differentiation to adipocytes. 5'-Deletion analysis of the PEMT promoter-luciferase constructs stably expressed in 3T3-L1 adipocytes identified a regulatory region between -471 and -371 bp (relative to the transcriptional start site). Competitive and supershift assays demonstrated binding sites for transcription factors Sp1, Sp3 (-408 to -413), and YY1 (-417 to -420). During differentiation of 3T3-L1 cells to adipocytes, the amount of Sp1 protein decreased by approximately 50% just prior to activation of PEMT. Transduction of 3T3-L1 adipocytes with retrovirus containing Sp1 cDNA demonstrated that Sp1 inhibited PEMT transcriptional activity. Similarly, short hairpin RNA directed against Sp1 in 3T3-L1 adipocytes enhanced PEMT transcriptional activation. Chromatin immunoprecipitation assays confirmed that Sp1 binds to the PEMT promoter, and this interaction decreases upon differentiation to adipocytes. These experiments directly link increased PEMT expression in adipocytes to decreased transcriptional expression of Sp1. In addition, our data established that Sp1 binding was required for tamoxifen-mediated inhibition of Pemt promoter activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,388

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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