MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2089176520 · doi:10.1289/ehp.1306937

<i>F2RL3</i> Methylation as a Biomarker of Current and Lifetime Smoking Exposures

2013· article· en· W2089176520 sur OpenAlexaff
Yan Zhang, Rongxi Yang, Barbara Burwinkel, Lutz Philipp Breitling, Hermann Brenner

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Health Perspectives · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensInstitute of Aging
Organismes subventionnairesBundesministerium für Bildung und Forschung
Mots-clésBiomarkerMethylationDNA methylationMedicineEnvironmental healthBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Recent genome-wide DNA methylation studies have found a pronounced difference in methylation of the F2RL3 gene (also known as PAR-4) in blood DNA according to smoking exposure. Knowledge on the variation of F2RL3 methylation by various degrees of smoking exposure is still very sparse. OBJECTIVES: We aimed to assess dose-response relationships of current and lifetime active smoking exposure with F2RL3 methylation. METHODS: In a large population-based study, we quantified blood DNA methylation at F2RL3 for 3,588 participants using matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry. Associations of smoking exposure with methylation intensity were examined by multiple linear regression, controlling for potential confounding factors and paying particular attention to dose-response patterns with respect to current and lifetime smoking exposure as well as time since cessation of smoking. RESULTS: F2RL3 methylation intensity showed a strong association with smoking status (p < 0.0001), which persisted after controlling for potential confounding factors. Clear inverse dose-response relationships with F2RL3 methylation intensity were seen for both current intensity and lifetime pack-years of smoking. Among former smokers, F2RL3 methylation intensity increased gradually from levels close to those of current smokers for recent quitters to levels close to never smokers for long-term (> 20 years) quitters. CONCLUSIONS: F2RL3 methylation is a promising biomarker for both current and long-term past tobacco exposure, and its predictive value for smoking-related diseases warrants further exploration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations133
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEnvironmental Health PerspectivesMême sujetEpigenetics and DNA MethylationTravaux en français237 207