<i>F2RL3</i> Methylation as a Biomarker of Current and Lifetime Smoking Exposures
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Recent genome-wide DNA methylation studies have found a pronounced difference in methylation of the F2RL3 gene (also known as PAR-4) in blood DNA according to smoking exposure. Knowledge on the variation of F2RL3 methylation by various degrees of smoking exposure is still very sparse. OBJECTIVES: We aimed to assess dose-response relationships of current and lifetime active smoking exposure with F2RL3 methylation. METHODS: In a large population-based study, we quantified blood DNA methylation at F2RL3 for 3,588 participants using matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry. Associations of smoking exposure with methylation intensity were examined by multiple linear regression, controlling for potential confounding factors and paying particular attention to dose-response patterns with respect to current and lifetime smoking exposure as well as time since cessation of smoking. RESULTS: F2RL3 methylation intensity showed a strong association with smoking status (p < 0.0001), which persisted after controlling for potential confounding factors. Clear inverse dose-response relationships with F2RL3 methylation intensity were seen for both current intensity and lifetime pack-years of smoking. Among former smokers, F2RL3 methylation intensity increased gradually from levels close to those of current smokers for recent quitters to levels close to never smokers for long-term (> 20 years) quitters. CONCLUSIONS: F2RL3 methylation is a promising biomarker for both current and long-term past tobacco exposure, and its predictive value for smoking-related diseases warrants further exploration.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».