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Enregistrement W2089216795 · doi:10.1094/pdis-94-9-1166c

First Report of Anthracnose Stem Canker of the Invasive Perennial Weed <i>Lepidium draba</i> Caused by <i>Colletotrichum higginsianum</i> in Europe

2010· article· en· W2089216795 sur OpenAlexaboutno aff
A. J. Caesar, R. T. Lartey, Thecan Caesar‐TonThat

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyWeedCankerBotanyPotato dextrose agarRhizoctonia solaniPerennial plantRhizoctoniaMyceliumHorticultureAgar

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Exotic perennial Lepidium draba, native to Eurasia, is an invasive weed in dense stands in rangelands and disturbed areas in several states of the western United States and an agricultural weed in the prairie provinces of Canada. To determine strategies, such as a potential multipathogen strategy (1), for biological control of the weed, surveys that included the native range were conducted in spring 2009 to detect diseases that occur on this weed. Several stunted and chlorotic plants were found scattered throughout a stand of L. draba growing in a vacant lot near Riddes, Switzerland (46°08′22.99″N, 7°9′19.02″E): ( http://maps.google.com/maps?source=earth&ll=46.13983490,7.15503250&layer= c&cbll=46.13983490,7.15503250&cbp=1,360,,0,5 ). Affected plants had reddish brown cankers on the lower stems, usually elongated and irregular in shape and slightly sunken. Insect injury was associated with the cankers. Symptoms often occurred on plants that were also infected with Rhizoctonia solani. After surface disinfestation with 0.1% sodium hypochlorite, tissue adjacent to and including lesions were plated on acidified potato dextrose agar and incubated at 20 to 25°C for 1 week. Zonate, dark gray colonies with sparse mycelia resulted that exhibited abundant, faintly pink spore masses with numerous dense clusters of black setae. Spores were single celled, hyaline, cylindrical to oval shaped, and 13.5 to 19.5 × 4 to 5.5 μm. Setae were 1- to 3-septate and 20 to 42 × 3 to 5 μm. These morphological traits correspond to Colletotrichum higginsianum. For pathogenicity tests, three 4-month-old L. draba plants were sprayed until runoff with a 106 conidia/ml suspension of the fungus and incubated for 72 h in plastic bags at 20 to 25°C in a quarantine greenhouse. Within 4 days, water-soaked lesions appeared that coalesced, resulting in chlorosis and collapse of inoculated leaves. Such symptoms are typical of infection by C. higginsianum and similar necrotrophic species (4). Fungi isolated from inoculated leaves were identified as C. higginsianum. To assess the host range of C. higginsianum, three plants each of turnip, radish, mustard greens, kale, broccoli raab, and Chinese cabbage, all in the Brassicaceae to which L. draba belongs, were inoculated with the same conditions used for the pathogenicity tests. Control plants in pathogenicity and host range tests were sprayed with sterile distilled water and all experiments were repeated at least once. All control plants were symptomless. Leaf necrosis occurred on radish and turnip and to a lesser extent on the lower leaves of Chinese cabbage and broccoli; numerous scattered dark necrotic flecks and small grayish leaf spots occurred on kale and mustard greens, respectively. These results are similar to previous studies (2,3) involving a cultivated species as the host in the field. The ITS1, 5.8S, and ITS2 sequences of this fungus (GenBank No. HM044877) were 99% similar to sequences of multiple isolates of C. higginsianum (GenBank Nos. AB042302, AB042303, AB455253, AJ558109, and AJ558110). To our knowledge, this is the first report of C. higginsianum on a wild species of the Brassicaceae, although a Colletotrichum sp. was reported on wild radish in Australia (1). References: (1) A. Maxwell and J. K. Scott. Australas. Plant Pathol. 37:523, 2008. (2) R. O'Connell et al. Mol. Plant-Microbe Interact. 17:272, 2004. (3) R. P. Scheffer. N. C. Agric. Exp. Stn. Tech. Bull. 1950. (4) H. Sun and J. Z. Zhang. Eur. J. Plant Pathol. 125:459, 2009.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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