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Enregistrement W2089283190 · doi:10.1186/1742-4690-8-s2-p51

Deregulation of microRNAs by HIV-1 Vpr leads to the development of neurocognitive disorders

2011· article· en· W2089283190 sur OpenAlexaff
Ruma Mukerjee, J. Robert Chang, Luis Del Valle, Asen Bagashev, Monika M. Gayed, Randolph B. Lyde, Brian J. Hawkins, Éric A. Cohen, Chris Power, S. Ausim Azizi, Bassel E. Sawaya

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensHeritage Medical Research ClinicUniversity of AlbertaUniversité de MontréalMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCell biologyBiologymicroRNAEndoplasmic reticulumGeneCREBGeneticsTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Studies have shown that HIV-infected patients develop neurocognitive disorders that are marked by neuronal dysfunction. The lack of productive infection of neurons by HIV suggests that viral and cellular proteins, with neurotoxic activities, released from HIV-1 infected target cells cause this neuronal deregulation. The viral protein R, a protein encoded by HIV-1, has been shown to alter the expression of various important cytokines and inflammatory proteins in infected and uninfected cells, however the mechanisms involved remain unclear. Using human neuronal cell line, we found that Vpr can be taken up by neurons causing i- deregulation of calcium homeostasis, ii- endoplasmic reticulum-calcium release, iii-activation of the oxidative stress pathway, iv- mitochondrial dysfunction and v- synaptic retraction. In search for the cellular factors involved, we performed microRNAs and gene array assays using human neurons (primary cultures or cell line, SH-SY5Y) that we treated with recombinant Vpr proteins. Interestingly, Vpr deregulates the levels of several miRNAs (e.g. miR-34a) and their target genes (e.g. CREB), which could lead to neuronal dysfunctions. Therefore, we conclude that Vpr is a major player in neuronal dysfunction through deregulating miRNAs and their target genes, a phenomenon that could lead to the development of HAND.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,198
Score d'incertitude au seuil0,845

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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