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Enregistrement W2089327954 · doi:10.1897/08-574.1

Advanced fluorescence in situ hybridization to localize and quantify gene expression in Japanese medaka (<i>Oryzias latipes</i>) exposed to endocrine-disrupting compounds

2009· article· en· W2089327954 sur OpenAlexaff
June‐Woo Park, Amber R. Tompsett, Xiaowei Zhang, John L. Newsted, Paul D. Jones, Doris W.T. Au, Richard Yuen Chong Kong, Rudolf S.S. Wu, John P. Giesy, Markus Hecker

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Toxicology and Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReproductive biology and impacts on aquatic species
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOryziasBiologyAromataseGene expressionIn situ hybridizationEndocrine disruptorEndocrinologyInternal medicineVitellogeninAndrologyEndocrine systemGeneHormoneGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In an earlier study, we described the development of fluorescence in situ hybridization (FISH) using confocal microscopy to localize and quantify gene expression in fish. Here, we report the results of FISH application to investigate effects of model endocrine-disrupting chemicals (EDCs), 17alpha-ethinylestradiol (EE2) and 17beta-trenbolone (TB), on expressions of EDC-responsive genes in Japanese medaka (Oryzias latipes) at the cellular/tissue level paired with histological observation. Gene expressions of vitellogenin-II (Vit-II), androgen receptor (AR), and cytochrome P450 gonadal aromatase (CYP19a) were determined after exposure to 5, 50, or 500 ng/L of EE2 or 50, 500, or 5,000 ng/L of TB for 7 d. Exposure to the greatest concentration of EE2 or TB significantly reduced fecundity and caused histological alterations in gonads. 17alpha-Ethinylestradiol induced Vit-II expression in both male gonads and liver relative to controls and resulted in greater intensity of hematoxylin staining in hepatocytes, which was significantly correlated with Vit-II induction in liver. When exposed to EE2 at less than 50 ng/L, CYP19a expression associated with early stage oocytes was greater than that in controls. However, at 500 ng/L, this trend was reversed. The greater Vit-II expression in testis from all EE2 groups, and the lesser expression of CYP19a in ovaries from the 500 ng/L group, likely is related to changes in the number of cells in which these genes are predominantly expressed rather than to an increase in expression per cell. 17beta-Trenbolone significantly induced AR expression in ovaries but did not alter AR expression in female liver. It was concluded that FISH combined with histology enables advanced elucidation of molecular effects of chemicals by associating changes in gene expression with certain tissues and/or cell types and allows these changes to be related to histological effects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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