The Laboratory Impact of Changing Syphilis Screening From the Rapid-Plasma Reagin to a Treponemal Enzyme Immunoassay: A Case-study From the Greater Toronto Area
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: In 2005, syphilis screening in the Greater Toronto Area of Canada moved from the rapid plasma reagin (RPR) to a treponemal enzyme immunoassay (EIA). We sought to understand the consequences of this change on laboratory results and testing patterns with a population-based retrospective study of laboratory-based diagnoses of syphilis. METHODS: Samples positive under RPR (1998-2005) and EIA (2005-2008) screening were confirmed with an alternate treponemal test, and during the latter period underwent RPR testing. We compared monthly rates and the forecasting relationship between positives and future submissions with time-series methods, and assessed risk factors for EIA(+)/RPR(-) results using Poisson regression. RESULTS: A total of 3,092,938 submissions were included. Following EIA implementation, confirmed positive rates increased by 10.3 per 100,000 population (P<0.001). 0.59% of EIA(+)/RPR(-) individuals converted to RPR(+) within 2 months. EIA(+)/RPR(-) patients were more likely to be male (incidence rate ratio [IRR]: 2.3, 95% confidence interval [CI]: 1.6-2.5), asymptomatic (IRR: 1.8, 95% CI: 1.3-2.8), and aged>50 years (IRR: 2.4, 95% CI: 1.6-3.5) than those with EIA(+)/RPR(+) results. We detected a significant positive feedback loop between positive tests and subsequent submissions. This relationship was only transiently evident for EIA(+)/RPR(-) results up to 1 year following the changeover. CONCLUSIONS: EIA screening facilitates identification of probable latent syphilis and earlier serological detection of infectious syphilis, but may transiently cause increases in testing and indirectly suggests that physicians' interpretation of RPR(-) serology may lead to partner testing. In the absence of a true gold standard, implementation of EIA screening warrants careful communication regarding serological interpretation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».