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Enregistrement W2089400875 · doi:10.1139/w07-025

<i>Myrothecium roridum Tri4</i> encodes a multifunctional oxygenase required for three oxygenation steps

2007· article· en· W2089400875 sur OpenAlexvenueno aff
Susan P. McCormick, Nancy J. Alexander

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and fungal interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTrichotheceneSesquiterpeneFusariumFarnesyl pyrophosphateBiologyGene clusterGeneMicrobiologyStereochemistryBiochemistryChemistryBiosynthesisBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The biosyntheses of both macrocyclic trichothecenes in Myrothecium roridum and simple trichothecenes in Fusarium species begin with the cyclization of farnesyl pyrophosphate to form the sesquiterpene hydrocarbon trichodiene. A previous study showed that Myrothecium has a cluster of 3 genes that are homologous with Fusarium trichothecene genes: Tri4, a P450 oxygenase; Tri5, the sesquiterpene cyclase; and Tri6, a zinc-finger regulatory gene. Fusarium graminearum Tri4 (FgTri4) and M. roridum MrTri4 (MrTri4) have 66.9% identity. In this study, MrTri4 was expressed in Fusarium verticillioides. Liquid cultures of transformant strains expressing MrTri4 converted exogenous trichodiene to isotrichodiol, indicating that MrTri4 controls 3 oxygenation steps and that the product of MrTRI4 is isotrichodiol.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,940
Score d'incertitude au seuil0,752

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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