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Enregistrement W2089448901 · doi:10.1002/poc.777

Pre‐steady‐state kinetic studies of rat kidney γ‐glutamyl transpeptidase confirm its ping‐pong mechanism

2004· article· en· W2089448901 sur OpenAlexafffund
Jeffrey W. Keillor, Annie Ménard, Roselyne Castonguay, Christian Lherbet, Caroline Rivard

Notice bibliographique

RevueJournal of Physical Organic Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSulfur Compounds in Biology
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChemistryAcylationSubstrate (aquarium)StereochemistryGlutathioneCysteineMoietyEnzymeAmideBiochemistryCatalysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The enzyme γ‐glutamyl transpeptidase (GGT) is implicated in cellular detoxification, the biosynthesis of leukotrienes and control of the physiological concentration of glutathione. It also plays important roles in Parkinson's disease, diabetes, apoptosis inhibition and cancer drug resistance. It catalyses the breakdown of its in vivo substrate, glutathione, by cleaving the amide bond between the γ‐glutamyl and the cysteinylglycine moieties. Threonine is proposed to act as the nucleophile of GGT in the formation of the γ‐glutamyl acyl enzyme intermediate during the acylation step. The γ‐glutamyl moiety is then transferred to a primary amine acceptor substrate (an amino acid or dipeptide) or to a water molecule, to form a compound containing a new isopeptide bond or glutamate in the transamidation or hydrolysis reactions, respectively. In spite of the importance of the role of GGT in human physiology, there is a lack of information about the mechanisms of its catalytic reactions, and in particular the nature of the intermediate formed during the acylation step. In order to gain insight into the formation of the acyl enzyme intermediate, different D‐γ‐glutamylanilides substituted in the para position with electron‐withdrawing and electron‐donating groups were used as donor substrates under conditions where water served as acceptor substrate. A Hammett plot with a slope of zero was obtained for the steady‐state hydrolysis reaction for which deacylation is the rate‐ limiting step. To confirm the ping‐pong mechanism, pre‐steady‐state kinetics of this reaction were then performed with the donor substrate D‐γ‐glutamyl‐p‐nitroanilide, which liberates the chromophore p‐nitroaniline. Experiments using a stopped‐ flow spectrometer and a rapid mix–quench apparatus gave biphasic traces with a burst up to ∼65 ms, the amplitude of which corresponds well with the concentration of the enzyme. These burst kinetics were also observed in the presence of L‐methionine at concentrations ∼15‐fold below its KM value, where deacylation would still be rate limiting. These observations are consistent with the formation of an intermediate during the rapid acylation step and support the modified ping‐pong mechanism proposed for GGT‐ mediated hydrolysis and aminolysis. Copyright © 2004 John Wiley & Sons, Ltd.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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