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Enregistrement W2089448901 · doi:10.1002/poc.777

Pre‐steady‐state kinetic studies of rat kidney γ‐glutamyl transpeptidase confirm its ping‐pong mechanism

2004· article· en· W2089448901 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Physical Organic Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSulfur Compounds in Biology
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChemistryAcylationSubstrate (aquarium)StereochemistryGlutathioneCysteineMoietyEnzymeAmideBiochemistryCatalysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The enzyme γ‐glutamyl transpeptidase (GGT) is implicated in cellular detoxification, the biosynthesis of leukotrienes and control of the physiological concentration of glutathione. It also plays important roles in Parkinson's disease, diabetes, apoptosis inhibition and cancer drug resistance. It catalyses the breakdown of its in vivo substrate, glutathione, by cleaving the amide bond between the γ‐glutamyl and the cysteinylglycine moieties. Threonine is proposed to act as the nucleophile of GGT in the formation of the γ‐glutamyl acyl enzyme intermediate during the acylation step. The γ‐glutamyl moiety is then transferred to a primary amine acceptor substrate (an amino acid or dipeptide) or to a water molecule, to form a compound containing a new isopeptide bond or glutamate in the transamidation or hydrolysis reactions, respectively. In spite of the importance of the role of GGT in human physiology, there is a lack of information about the mechanisms of its catalytic reactions, and in particular the nature of the intermediate formed during the acylation step. In order to gain insight into the formation of the acyl enzyme intermediate, different D ‐γ‐glutamylanilides substituted in the para position with electron‐withdrawing and electron‐donating groups were used as donor substrates under conditions where water served as acceptor substrate. A Hammett plot with a slope of zero was obtained for the steady‐state hydrolysis reaction for which deacylation is the rate‐ limiting step. To confirm the ping‐pong mechanism, pre‐steady‐state kinetics of this reaction were then performed with the donor substrate D ‐γ‐glutamyl‐ p ‐nitroanilide, which liberates the chromophore p ‐nitroaniline. Experiments using a stopped‐ flow spectrometer and a rapid mix–quench apparatus gave biphasic traces with a burst up to ∼65 ms, the amplitude of which corresponds well with the concentration of the enzyme. These burst kinetics were also observed in the presence of L ‐methionine at concentrations ∼15‐fold below its K M value, where deacylation would still be rate limiting. These observations are consistent with the formation of an intermediate during the rapid acylation step and support the modified ping‐pong mechanism proposed for GGT‐ mediated hydrolysis and aminolysis. Copyright © 2004 John Wiley & Sons, Ltd.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle