Transcriptional Activation of the SALL1 by the Human SIX1 Homeodomain during Kidney Development
Notice bibliographique
Résumé
SALL1 is a member of the SAL gene family that encodes a group of putative developmental transcription factors. SALL1 plays a critical role during kidney development as mutations of the human SALL1 gene cause Townes-Brocks syndrome, which is associated with kidney malformation. Deletion of the mouse Sall1 gene results in renal agenesis or severe dysgenesis. To date, little is known about the molecular mechanisms controlling the regulation of SALL1 expression. This report describes the cloning and characterization of the human SALL1 gene promoter. Consensus binding sites were identified for several transcription factors, with multiple sites for WT1 and SIX1. In transient transfection assays, SALL1 promoter activity was higher in HEK-293 human kidney cells and COS-7 monkey kidney cells than in NIH-3T3 fibroblasts, consistent with its role in kidney development. Transcription from the SALL1 promoter was strikingly activated by the SIX1 protein. Utilizing a luciferase reporter gene assay, endogenous or exogenously added SIX1 activated the SALL1 promoter. Overexpression of SIX1 induced a significant increase in the endogenous SIX1 protein. In addition, co-expression of SIX1 and Eya1 resulted in a significant increase in the SALL1 promoter activity when compared with either SIX1 or Eya1 alone. Finally, we demonstrate that SIX1 was able to bind to the SALL1 promoter by retardation assays and that deletion of the putative element of SIX1 significantly diminishes the SALL1 promoter activity response to SIX1 stimulation. Our findings, when taken together, indicate that SALL1 is a likely target gene for SIX1 during kidney development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».