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Enregistrement W2089464420 · doi:10.1002/gcc.20292

Array CGH analysis of pediatric medulloblastomas

2005· article· en· W2089464420 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueGenes Chromosomes and Cancer · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésBreakpointComparative genomic hybridizationChromosomeBiologyGeneticsHigh resolutionComputational biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Brain tumors are the second most common childhood cancer. We used high-resolution array comparative genomic hybridization (aCGH) to analyze losses and gains of genetic material from 24 medulloblastomas. The bacterial artificial chromosome clones were ordered on the array, allowing for an average resolution of approximately 420 kilobases. The advantage of this high resolution is that the breakpoints associated with subregional chromosome copy number aberrations can be accurately defined, which in turn allows candidate genes within these regions to be readily defined. In this analysis, we confirmed the frequent involvement of loss of 17p and gain of 17q, although we have now established the position of the breakpoint that consistently lies in the chr17:18318880-19046234 region of the chromosome. Other frequent losses were seen on 8p, 10q, 16q, and 20p, and frequent gains were seen on 2p, 4p, 7, and 19. In addition, the fine-resolution mapping provided by aCGH made it possible to define small chromosome deletions in 1q23.3-q24.2, 2q13.12-q13.2, 6q25-qter, 8p23.1, 10q25.1, and 12q13.12-q13.2. Overall, amplification events were rare, the most common involving MYC (16%), on 8q, although isolated events were seen in 10p11 and 3q.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,254
Score d'incertitude au seuil0,447

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle