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Enregistrement W2089507714 · doi:10.1021/jp046449m

Fragmentation Mechanisms of Product Ions from Protonated Tripeptides

2004· article· en· W2089507714 sur OpenAlexafffund
Houssain El Aribi, Galina Orlova, Christopher F. Rodriquez, David R. P. Almeida, Alan C. Hopkinson, K. W. Michael Siu

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChemistryProtonationFragmentation (computing)IonIminiumIntramolecular forceDissociation (chemistry)CarbeneCollision-induced dissociationPhotochemistryCrystallographyStereochemistryMass spectrometryPhysical chemistryOrganic chemistryTandem mass spectrometry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dissociation chemistries of the primary fragment ions from the tripeptides, GAG and AGG, were examined both experimentally and theoretically, and compared with those from GGG [El Aribi, H.; Rodriquez, C. F.; Almeida, D. R. P.; Ling, Y.; Mak, W. W.-N.; Hopkinson, A. C.; Siu, K. W. M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9229−9236]. Findings in this study with GAG and AGG confirm and extend those in the earlier study on GGG. Fragmentation of the b 2 to a 2 ion from GAG and AGG is qualitatively similar to that from GGG; stabilization by the methyl group, however, results in generally lower energies for GAG. Fragmentation of the a 2 ion from GAG produces both the a 1 (protonated methanimine) and the internal iminium ion (protonated ethanimine). By contrast, fragmentation of the a 2 ion from AGG produces only the a 1 ion (protonated ethanimine). In GAG, formation of the internal iminium ion requires an intramolecular proton transfer in the proton-bridged complex after cleavage of CO, which is absent in AGG. The a 1 ion from GAG is postulated to form via cleavage of the vibrationally excited proton-bridged complex prior to proton transfer, favored under higher collision-energy conditions. The critical transition state in the fragmentation of the b 2 to a 1 ion is best described as a complex between the a 1 ion and a carbene. Although details differ, in both GAG and AGG, there is a proton transfer from the terminal amino group to the carbene carbon and a second proton transfer from the ring nitrogen back to the terminal amino group. Separation of the components then yields the a 1 ion and a neutral oxazolone.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,089
Score d'incertitude au seuil0,718

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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