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Enregistrement W2089580966 · doi:10.1139/g06-111

Three new satellite sequences and a mobile element found inside HSP70 introns of the Mediterranean mussel (Mytilus galloprovincialis)

2006· article· en· W2089580966 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueGenome · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueTitanium Alloys Microstructure and Properties
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyIntronMytilusGeneticsMobile genetic elementsTransposable elementGeneGenomeFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report the characterization of 3 new repetitive sequences from the bivalve mollusc Mytilus galloprovincialis, designated Mg1, Mg2, and Mg3, with monomer lengths of 169, 260, and 70 bp, respectively. The 3 repeats together constitute approximately 7.8% of the M. galloprovincialis genome and were found, together with ApaI-type 2 repeats, inside the introns of 2 genes of the HSP70 family, hsc70 and hsc71. Both the monomer length and the genomic content of the repeats indicate satellite sequences. The Mg1 repetitive region and its flanking sequences exhibit significant homology to CvE, a member of the Pearl family of mobile elements found in the eastern oyster (Crassostrea virginica). Thus, the whole homologous region is designated MgE, the first putative transposable element characterized in M. galloprovincialis. The ApaI, Mg2, and Mg3 repeats are continuously arranged inside the introns of both the hsc70 and hsc71 genes. The presence of perfect inverted repeats flanking the ApaI-Mg2-Mg3 repetitive region, as well as a sequence analysis of the repeats, indicates a transposition-like insertion of this region. The genes of the HSP70 family are highly conserved, and the presence of repetitive DNA or of mobile elements inside their introns is reported here for the first time.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,455
Score d'incertitude au seuil0,616

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle