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Enregistrement W2089614435 · doi:10.1074/jbc.m200836200

Human Herpesvirus 6 Immediate-Early 1 Protein Is a Sumoylated Nuclear Phosphoprotein Colocalizing with Promyelocytic Leukemia Protein-associated Nuclear Bodies

2002· article· en· W2089614435 sur OpenAlexaff
Annie Gravel, Jean Gosselin, Louis Flamand

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier de l'Université Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPromyelocytic leukemia proteinBiologySUMO proteinMolecular biologyNuclear proteinPhosphoproteinDeath-associated protein 6Cell biologyPhosphorylationGeneticsUbiquitinGeneTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Immediate-early (IE) proteins are the first proteins expressed following viral entry and play a crucial role in the initiation of infection. We report the cloning and characterization of a full-length IE1 transcript and protein (IE1B) from human herpesvirus 6 (HHV-6) variant B. The IE1B transcript consists of five exons (3720 nucleotides), three of which are coding for the IE1 protein. The 1078-amino acid-long IE1B protein is 62% identical and 75% similar to the 941-amino acid IE1 from HHV-6 variant A. IE1B protein can be detected at 4 h post-infection (P.I.), and it is distributed as small intranuclear structures. The maximal number of IE1 bodies ( approximately 10-12/nucleus) is detected at 12 h P.I. after which the IE1 bodies condense into 1-3 larger entities by 24-48 h P.I. During infection the IE1B protein is phosphorylated on serine and threonine residues. IE1B undergoes further post-translational modification with its conjugation to the small ubiquitin-like modifier (SUMO-1) peptide. IE1B colocalizes with SUMO-1 and promyelocytic leukemia nuclear bodies during infection as well as in transfection experiments. Finally, IE1 from variant B is a weaker transactivator than IE1 from variant A, when assayed using heterologous promoters. Overall, the characterization of the HHV-6 IE1B protein presented highlights the similarity and divergence between IE1 from both variants and provides useful information pertaining to the early phase of infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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