Human Herpesvirus 6 Immediate-Early 1 Protein Is a Sumoylated Nuclear Phosphoprotein Colocalizing with Promyelocytic Leukemia Protein-associated Nuclear Bodies
Notice bibliographique
Résumé
Immediate-early (IE) proteins are the first proteins expressed following viral entry and play a crucial role in the initiation of infection. We report the cloning and characterization of a full-length IE1 transcript and protein (IE1B) from human herpesvirus 6 (HHV-6) variant B. The IE1B transcript consists of five exons (3720 nucleotides), three of which are coding for the IE1 protein. The 1078-amino acid-long IE1B protein is 62% identical and 75% similar to the 941-amino acid IE1 from HHV-6 variant A. IE1B protein can be detected at 4 h post-infection (P.I.), and it is distributed as small intranuclear structures. The maximal number of IE1 bodies ( approximately 10-12/nucleus) is detected at 12 h P.I. after which the IE1 bodies condense into 1-3 larger entities by 24-48 h P.I. During infection the IE1B protein is phosphorylated on serine and threonine residues. IE1B undergoes further post-translational modification with its conjugation to the small ubiquitin-like modifier (SUMO-1) peptide. IE1B colocalizes with SUMO-1 and promyelocytic leukemia nuclear bodies during infection as well as in transfection experiments. Finally, IE1 from variant B is a weaker transactivator than IE1 from variant A, when assayed using heterologous promoters. Overall, the characterization of the HHV-6 IE1B protein presented highlights the similarity and divergence between IE1 from both variants and provides useful information pertaining to the early phase of infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».