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Enregistrement W2089692553 · doi:10.1111/j.1399-3054.2006.00643.x

Characterization of the alternative oxidase of <i>Chlamydomonas reinhardtii</i> in response to oxidative stress and a shift in nitrogen source

2006· article· en· W2089692553 sur OpenAlexafffund
Teresa A. Molen, Dominic Rosso, Sarah Piercy, Denis P. Maxwell

Notice bibliographique

RevuePhysiologia Plantarum · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensWestern UniversityAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAlternative oxidaseChlamydomonas reinhardtiiAntimycin AOxidative stressBiologyNitrate reductaseReporter geneReactive oxygen speciesBiochemistryGene expressionChlamydomonasChemistryCell biologyGeneMitochondrionEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To study the transcriptional regulation of Aox1, the major alternative oxidase (AOX) gene, we fused 1072 bp of its promoter to the promoterless arylsulfatase reporter gene. We find that the reporter is strongly activated when cells are shifted from a medium containing ammonium to one containing nitrate but is unresponsive to treatments known to induce Aox1 in higher plants – H2O2, antimycin A and cold stress. However, induction of Aox1 by all these factors was found when changes in gene expression were monitored using RNA blot analysis. Our data suggest that transcriptional upregulation of Aox1 by H2O2, antimycin A and cold‐stress requires one or more enhancers which are not found in the proximal promoter region of the gene. Interestingly, while nitrate, H2O2 and cold stress result in increased AOX abundance and increased alternative pathway respiration, these changes are not seen when cells are treated with antimycin A. We find that H2O2, antimycin A and cold‐stress result in an increase in intracellular reactive oxygen species (ROS) but that a significant change in ROS does not occur when cells are shifted into a medium‐containing nitrate. Overall, our data are consistent with there being two distinct pathways regulating Aox1 transcription and AOX abundance in Chlamydomonas reinhardtii: one in response to oxidative stress and a second due to metabolic changes brought about by a shift in nitrogen source from ammonium to nitrate.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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