Circumscription of species in the genus <i>Sirodotia</i> (Batrachospermales, Rhodophyta) based on molecular and morphological data
Notice bibliographique
Résumé
Species level taxonomy and phylogeographical distribution patterns in the freshwater rhodophyte Sirodotia are resolved through phylogenetic inferences based on rbcL and cox2–3 sequence data. Previous studies focused on the taxonomy of specific Sirodotia species or the distributions across a limited geographical region. Our molecular phylogenies included samples attributable to five recognized Sirodotia species and include collections from Australia, Brazil, Costa Rica, Canada, Finland, Mexico, New Zealand, South Africa and the United States. Both rbcL and cox2–3 phylogenies inferred S. suecica, S. tenuissima and S. goebelii as a monophyletic group with little sequence divergence. This result supports the synonymy of S. tenuissima and S. goebelii with S. suecica (the species name with priority). Within this clade, samples collected from Australia and New Zealand formed a monophyletic group with no other discernible phylogeographical patterns within S. suecica. This result seems to be somewhat unusual in the Batrachospermales, as other species have shown greater genetic variation among geographically distant locations. As in previous studies, S. huillensis and S. delicatula were inferred as a separate species based on the rbcL phylogeny, supporting the current taxonomy. A specimen of S. aff. huillensis from South Africa, may represent a new species but further research is necessary before it can be designated as such.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».