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Enregistrement W2089969195 · doi:10.1093/femsec/fiv038

Resilience and adjustments of surface sediment bacterial communities in an enclosed shallow coastal lagoon, Magdalen Islands, Gulf of St. Lawrence, Canada

2015· article· en· W2089969195 sur OpenAlexafffundabout
Vani Mohit, Philippe Archambault, Connie Lovejoy

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Ecology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversité du Québec à RimouskiUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésGammaproteobacteriaBenthic zoneSedimentBiologyBiogeochemical cycleEcologyMesocosmDeltaproteobacteriaWater columnBenthosPhylumOceanographyCommunity structureEcosystemBacteriaGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacteria regulate global biogeochemical cycles and much of this activity occurs in shallow coastal sediments; however, little is known of the seasonality or how changes in environmental conditions influence the active sediment bacterial communities. Havre-aux-Maisons (Magdalen Islands, Canada), a relatively pristine enclosed shallow coastal lagoon, is of particular biological interest since it has no inflowing rivers and provides an opportunity to investigate non-estuarine shallow marine sediments. Potentially active taxa in surface sediments were identified over a 15-month period using high-throughput rRNA amplicon sequencing. Sediment bacterial communities were diverse at the species level, with high Beta diversity. Throughout most of the sampling period, communities consisted of taxa that were closely related to each other, suggesting that specific environmental conditions at a given time point favored taxa with similar ecological traits. However, bacterial phyla and proteobacterial classes were remarkably similar over time with a predominantly sulfur cycling community composed of sulfur-oxidizing Gammaproteobacteria and sulfate-reducing Deltaproteobacteria persisting over much of the sampling period, despite the oxygenated water column. This community was disrupted after a storm and less common phyla became relatively more abundant. Following this disruption, a high proportion of benthic Cyanobacteria colonized the sediment before the reestablishment of the sulfur-cycle-dominated community.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,754
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2015
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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