Resilience and adjustments of surface sediment bacterial communities in an enclosed shallow coastal lagoon, Magdalen Islands, Gulf of St. Lawrence, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Bacteria regulate global biogeochemical cycles and much of this activity occurs in shallow coastal sediments; however, little is known of the seasonality or how changes in environmental conditions influence the active sediment bacterial communities. Havre-aux-Maisons (Magdalen Islands, Canada), a relatively pristine enclosed shallow coastal lagoon, is of particular biological interest since it has no inflowing rivers and provides an opportunity to investigate non-estuarine shallow marine sediments. Potentially active taxa in surface sediments were identified over a 15-month period using high-throughput rRNA amplicon sequencing. Sediment bacterial communities were diverse at the species level, with high Beta diversity. Throughout most of the sampling period, communities consisted of taxa that were closely related to each other, suggesting that specific environmental conditions at a given time point favored taxa with similar ecological traits. However, bacterial phyla and proteobacterial classes were remarkably similar over time with a predominantly sulfur cycling community composed of sulfur-oxidizing Gammaproteobacteria and sulfate-reducing Deltaproteobacteria persisting over much of the sampling period, despite the oxygenated water column. This community was disrupted after a storm and less common phyla became relatively more abundant. Following this disruption, a high proportion of benthic Cyanobacteria colonized the sediment before the reestablishment of the sulfur-cycle-dominated community.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».