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Enregistrement W2090008866 · doi:10.1534/genetics.107.070359

<i>DDB2</i>, <i>DDB1A</i> and <i>DET1</i> Exhibit Complex Interactions During Arabidopsis Development

2007· article· en· W2090008866 sur OpenAlex
Wesam M. Al Khateeb, Dana F. Schroeder

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLight effects on plants
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyArabidopsisPhenotypeMutantGeneticsHypocotylRosette (schizont appearance)DDB1Cell biologyUbiquitin ligaseBotanyGeneUbiquitin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Damaged DNA-binding proteins 1 and 2 (DDB1 and DDB2) are subunits of the damaged DNA-binding protein complex (DDB). DDB1 is also found in the same complex as DE-ETIOLATED 1 (DET1), a negative regulator of light-mediated responses in plants. Arabidopsis has two DDB1 homologs, DDB1A and DDB1B. ddb1a single mutants have no visible phenotype while ddb1b mutants are lethal. We have identified a partial loss-of-function allele of DDB2. To understand the genetic interaction among DDB2, DDB1A, and DET1 during Arabidopsis light signaling, we generated single, double, and triple mutants. det1 ddb2 partially enhances the short hypocotyl and suppresses the high anthocyanin content of dark-grown det1 and suppresses the low chlorophyll content, early flowering time (days), and small rosette diameter of light-grown det1. No significant differences were observed between det1 ddb1a and det1 ddb1a ddb2 in rosette diameter, dark hypocotyl length, and anthocyanin content, suggesting that these are DDB1A-dependent phenotypes. In contrast, det1 ddb1a ddb2 showed higher chlorophyll content and later flowering time than det1 ddb1a, indicating that these are DDB1A-independent phenotypes. We propose that the DDB1A-dependent phenotypes indicate a competition between DDB2- and DET1-containing complexes for available DDB1A, while, for DDB1A-independent phenotypes, DDB1B is able to fulfill this role.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,670
Score d'incertitude au seuil0,289

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle