<i>DDB2</i>, <i>DDB1A</i> and <i>DET1</i> Exhibit Complex Interactions During Arabidopsis Development
Notice bibliographique
Résumé
Damaged DNA-binding proteins 1 and 2 (DDB1 and DDB2) are subunits of the damaged DNA-binding protein complex (DDB). DDB1 is also found in the same complex as DE-ETIOLATED 1 (DET1), a negative regulator of light-mediated responses in plants. Arabidopsis has two DDB1 homologs, DDB1A and DDB1B. ddb1a single mutants have no visible phenotype while ddb1b mutants are lethal. We have identified a partial loss-of-function allele of DDB2. To understand the genetic interaction among DDB2, DDB1A, and DET1 during Arabidopsis light signaling, we generated single, double, and triple mutants. det1 ddb2 partially enhances the short hypocotyl and suppresses the high anthocyanin content of dark-grown det1 and suppresses the low chlorophyll content, early flowering time (days), and small rosette diameter of light-grown det1. No significant differences were observed between det1 ddb1a and det1 ddb1a ddb2 in rosette diameter, dark hypocotyl length, and anthocyanin content, suggesting that these are DDB1A-dependent phenotypes. In contrast, det1 ddb1a ddb2 showed higher chlorophyll content and later flowering time than det1 ddb1a, indicating that these are DDB1A-independent phenotypes. We propose that the DDB1A-dependent phenotypes indicate a competition between DDB2- and DET1-containing complexes for available DDB1A, while, for DDB1A-independent phenotypes, DDB1B is able to fulfill this role.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».