Synergy Between Deacetylase Inhibitors and IL-1β in Activation of the Serum Amyloid A2 Gene Promoter
Notice bibliographique
Résumé
Butyrate (NaBu) regulates intestinal inflammatory gene expression in part through inhibition of deacetylase activity, but the exact mechanisms involved remain to be determined. In this study, we showed by Northern blot a synergistic induction of the acute phase protein gene SAA2 with a combination of deacetylase inhibitors (Trichostatin A or NaBu) and IL-1beta in the colon carcinoma cell line Caco-2. While the NF-kappa B DNA-binding site was essential for SAA2 regulation by IL-1beta and deacetylase inhibitors, the C/EBP DNA-binding site modulated SAA2 expression levels, as assessed by transient transfection assays and mutagenesis studies. NaBu was sufficient to induce SAA2 expression after transient treatment with IL-1beta and, conversely, IL-1beta induced SAA2 after transient treatment with NaBu. These data suggest that pretreatment with either NaBu or IL-1beta predisposes the SAA2 promoter to further stimulation. Indeed, both NaBu and IL-1beta led to increased recruitment of NF-kappa B p65, C/EBPbeta, and C/EBP delta, and decreased NF-kappa B p50 and C/EBP alpha DNA-binding to the proximal SAA2 promoter, as assessed by chromatin immunoprecipitation assays. Interestingly, while IL-1beta, in contrast to NaBu, induced histone H4 acetylation, addition of IL-1beta and NaBu increased histone H4 acetylation and both C/EBPbeta and NF-kappa B p65 DNA-binding. Therefore, these results suggest that NaBu and IL- 1beta mediate SAA2 synergistic induction by establishing and maintaining similar and complementary chromatin modifications and transcription factor recruitment as well. In addition to global effects, NaBu specifically regulate gene expression, as exemplified by SAA2.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».