MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2090028859 · doi:10.1089/dna.2005.24.209

Synergy Between Deacetylase Inhibitors and IL-1β in Activation of the Serum Amyloid A2 Gene Promoter

2005· article· en· W2090028859 sur OpenAlexaff
Mylène Blais, Antoine Désilets, Claude Asselin

Notice bibliographique

RevueDNA and Cell Biology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Glycation End Products research
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMolecular biologyTrichostatin ABiologyHistone deacetylase inhibitorHistone deacetylaseChromatin immunoprecipitationTranscription factorAcetylationGene expressionPromoterHistoneBiochemistryDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Butyrate (NaBu) regulates intestinal inflammatory gene expression in part through inhibition of deacetylase activity, but the exact mechanisms involved remain to be determined. In this study, we showed by Northern blot a synergistic induction of the acute phase protein gene SAA2 with a combination of deacetylase inhibitors (Trichostatin A or NaBu) and IL-1beta in the colon carcinoma cell line Caco-2. While the NF-kappa B DNA-binding site was essential for SAA2 regulation by IL-1beta and deacetylase inhibitors, the C/EBP DNA-binding site modulated SAA2 expression levels, as assessed by transient transfection assays and mutagenesis studies. NaBu was sufficient to induce SAA2 expression after transient treatment with IL-1beta and, conversely, IL-1beta induced SAA2 after transient treatment with NaBu. These data suggest that pretreatment with either NaBu or IL-1beta predisposes the SAA2 promoter to further stimulation. Indeed, both NaBu and IL-1beta led to increased recruitment of NF-kappa B p65, C/EBPbeta, and C/EBP delta, and decreased NF-kappa B p50 and C/EBP alpha DNA-binding to the proximal SAA2 promoter, as assessed by chromatin immunoprecipitation assays. Interestingly, while IL-1beta, in contrast to NaBu, induced histone H4 acetylation, addition of IL-1beta and NaBu increased histone H4 acetylation and both C/EBPbeta and NF-kappa B p65 DNA-binding. Therefore, these results suggest that NaBu and IL- 1beta mediate SAA2 synergistic induction by establishing and maintaining similar and complementary chromatin modifications and transcription factor recruitment as well. In addition to global effects, NaBu specifically regulate gene expression, as exemplified by SAA2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,226

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueDNA and Cell BiologyMême sujetAdvanced Glycation End Products researchTravaux en français237 207