Marker assisted selection for S5 neutral allele in inter-subspecific hybridization of rice
Notice bibliographique
Résumé
The present level of heterosis in indica hybrids can be improved by exploiting inter-subspecific gene pool. Hybrid sterility in inter-subspecific hybridization is the major bottleneck, however use ofwide compatible varieties (WCVs) carrying neutral alleles helps in producing fertile hybrids. Conventionally WC varieties are identified by tedious test crossing. To identify WC varieties, 325 tropical japonica and 7 indica lines have been genotyped for the presence of S5 n (neutral allele) with the help of S5-MMS (multiplex marker system) which clearly distinguish indica, japonica and S5 neutral allele. Of the 325 lines, 90 tropical japonica and Swarna ( indica ) showed the presence of S5 n . One hundred and fifty F 1 hybrids, indica × japonica (I × J), were evaluated for their hybrid sterility and spikelet fertility percentage ranged from 4 to 97%. The I × J hybrids with S5n showed higher spikelet fertility; however some hybrids without S5 n showed higher spikelet fertility and among them few tropical japonica lines identified to carry indica allele by S5-MMS marker system, therefore this functional marker is a powerful tool for molecular screening of WC varieties. Hybrids with S5 n showed higher sterility indicating existence of other than embryo sac sterility mechanism of I X J crosses, since S5 n overcomes only embryo sac hybrid sterility. In wild rice O.rufipogon accessions the S5 n allelic status was determined by using S5-MMS marker system. To conclude, S5-MMS is a powerful tool PCR based and with low cost, highly efficient as marker system in identifying WC varieties in different mapping populations including wild rice accessions. Whichsaves one year of breeder’s valuable time in inter-subspecific hybridization in rice.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».