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Enregistrement W2090080088 · doi:10.1139/b03-021

Microsatellite analysis of genetic diversity in four populations of<i>Populus tremuloides</i>in Quebec

2003· article· en· W2090080088 sur OpenAlexvenueaboutno aff
Janet Wyman, Anne Bruneau, M. Francine Tremblay

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrosatelliteBiologyGenetic diversityGenetic variationPopulationAlleleGenotypeGeneticsGenetic variabilityGenetic distanceEvolutionary biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To determine overall genetic variability in aspen (Populus tremuloides Michx.) along the clay belt of northwestern Quebec, four populations were sampled at the transition zone between mixed-wood and conifer-dominated forests using a hierarchical strategy. Our objectives were (i) to estimate gene diversity among and within populations using microsatellite markers and (ii) to examine whether clonal structuring in aspen could be detected. For each population, three stands at least 1 km apart were sampled. Within each stand, five putative clones were sampled with a distance of 50 m between each clone. To examine potential genetic diversity within clones, for three of the putative clones sampled per stand, the three trees closest to this individual (potential ramets) were also sampled. All samples were analysed at four microsatellite loci. Measures of genetic variation all indicated that most of the variation occurred within rather than among the populations. R st , based on a stepwise mutation model, was 0.0409, slightly higher than F st , which was based on infinite allele model (0.0323). Within each stand, DNA fingerprint of five putative clones allowed the differentiation of genetically distinct individuals within these putative clones, and from 1.62 to 2.2 times more genetically distinct individuals were identified than by morphological identification. In the present study there was no correlation between the mean distance of the potential ramet to the central trunk (potential ramets were often within 2–3 m of the central trunk) and the possibility of the central trunk and ramet sharing the same genotype. The number of unique genotypes for the three putative clones sampled per stand varied from 11 genotypes per 15 samples to 14 per 15 samples. Consequently, it was not possible to identify clones by either distance from a given central trunk or morphological characteristics. Thus, after stand disturbance, suckers from different genotypes are likely to be closely mixed.Key words: genetic diversity, Populus tremuloides, microsatellites, clone size.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,660
Score d'incertitude au seuil0,956

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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