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Enregistrement W2090118249 · doi:10.5551/jat.5207

Cultivation of Enterobacter Hormaechei from Human Atherosclerotic Tissue

2011· article· en· W2090118249 sur OpenAlexaff
B. Rafferty, Svetlana M. Dolgilevich, Sergey Kalachikov, Irina Morozova, Jingyue Ju, Susan Whittier, Roman Nowygrod, Emil Kozarov

Notice bibliographique

RevueJournal of Atherosclerosis and Thrombosis · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfective Endocarditis Diagnosis and Management
Établissements canadiensColumbia College
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyMicrobiologyBacteriaEnterobacterGeneEscherichia coliGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: To determine whether culturable bacterial strains are present in human atheromatous tissue and to investigate their properties using culture, quantitative PCR, metagenomic screening, genomic and biochemical methods. METHODS: We analyzed femoral atherosclerotic plaque and five pairs of diseased and healthy arterial tissue for the presence of culturable bacteria using cell cultures and genomic analysis. RESULTS: Gram negative aerobic bacilli were cultivated from the plaque tissue. Ribosomal 16S DNA amplification and sequencing identified the isolates as Enterobacter hormaechei. The isolate was resistant to ampicillin, cefazolin, and erythromycin. A circular 10 kb plasmid was isolated from the strain. Antibiotic protection assays of the isolate demonstrated invasive ability in a human monocytic cell line. To extend the study, five matched pairs of diseased and healthy aortic tissue were analyzed via quantitative PCR. Eubacterial 16S rDNA was detected in all specimens, however, E. hormaechei DNA was detected in surprisingly high numbers in two of the diseased tissues only. CONCLUSIONS: While it is well documented that inflammation is an important risk factor for vascular pathophysiology, the association of bacteria with atherosclerosis has not been clearly established, in large part due to the inability to isolate live bacteria from atheromatous tissue. This is the first study providing direct evidence of Enterobacter spp. associated with atheromatous tissues. The data suggest that chronic infection with bacteria may be an under-reported etiologic factor in vascular pathogenesis. Importantly, characterization of the clinical isolate supports a model of atherogenesis where systemic dissemination of bacteria to atherosclerotic sites may occur via internalization in phagocytic cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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