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Enregistrement W2090199861 · doi:10.1002/jcp.21064

14‐3‐3 sigma isoform interacts with the cytoplasmic domain of the transmembrane BP180 in keratinocytes

2007· article· en· W2090199861 sur OpenAlexaff
Yunyuan Li, Xiaoyue Lin, Ruhangiz T. Kilani, Jonathan Jones, Aziz Ghahary

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Physiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématique14-3-3 protein interactions
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin Diseases
Mots-clésGene isoformCytoplasmTransmembrane proteinTransmembrane domainDomain (mathematical analysis)Cell biologySigmaChemistryFocus (optics)BiologyPhysicsMembraneBiochemistryMathematicsGeneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The protein bullous pemphigoid antigen-2 (BPAG2/BP180/collagen type XVII) plays a key role in attachment of basal keratinocytes to epidermal basement membrane. The binding of BP180 with either integrin alpha6, integrin beta4, or bullous pemphigoid antigen-1 (BPAG1/BP230) is critical for this attachment in skin. The protein 14-3-3 sigma, also known as stratifin and a marker for epithelial cells, is a member of a highly conserved small acidic 14-3-3 protein family naturally found in all eukaryotic cells. Here, we have used a 14-3-3sigma GST pull-down screening assay and showed that sigma (sigma) isoform of the 14-3-3 protein family interacts with the cytoplasmic N-terminal domain of BP180. Analysis of a series of truncated or deleted 14-3-3sigma revealed that only intact 14-3-3sigma molecule, but not any of its fragments can interact with BP180. This finding suggests that conformation and possible dimerization of 14-3-3 sigma is essential for this interaction. Further, a BP180 co-immunoprecipitation (IP) and its reverse IP assays were conducted and the results confirmed that 14-3-3 sigma interacts with cytoplasmic domain, but not ecto-domain of the BP180. In conclusion, the finding of this study provides evidence that 14-3-3sigma isoform interacts with BP180 which is a major component of hemidesmosome involved in the attachment of epidermis to the basement membrane in skin. However, the significance of this interaction in hemidesmosome formation and/or attachment needs to be explored.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,301

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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