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Enregistrement W2090253955 · doi:10.1016/j.cub.2009.12.032

Cell-Nonautonomous Regulation of C. elegans Germ Cell Death by kri-1

2010· article· en· W2090253955 sur OpenAlexafffund
Shu Ito, Sebastian Greiss, Anton Gartner, W. Brent Derry

Notice bibliographique

RevueCurrent Biology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research UKWellcome Trust
Mots-clésBiologyProgrammed cell deathCell biologyApoptosisCellDNA damageCell fate determinationCaspaseGerm cellGeneticsCell growthGeneDNATranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Programmed cell death (or apoptosis) is an evolutionarily conserved, genetically controlled suicide mechanism for cells that, when deregulated, can lead to developmental defects, cancers, and degenerative diseases [1Ellis H.M. Horvitz H.R. Genetic control of programmed cell death in the nematode C. elegans.Cell. 1986; 44: 817-829Abstract Full Text PDF PubMed Scopus (1362) Google Scholar, 2Hipfner D.R. Cohen S.M. Connecting proliferation and apoptosis in development and disease.Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2004; 5: 805-815Crossref PubMed Scopus (173) Google Scholar]. In C. elegans, DNA damage induces germ cell death by signaling through cep-1/p53, ultimately leading to the activation of CED-3/caspase [3Ahmed S. Hodgkin J. MRT-2 checkpoint protein is required for germline immortality and telomere replication in C. elegans.Nature. 2000; 403: 159-164Crossref PubMed Scopus (225) Google Scholar, 4Gartner A. Milstein S. Ahmed S. Hodgkin J. Hengartner M.O. A conserved checkpoint pathway mediates DNA damage-induced apoptosis and cell cycle arrest in C. elegans.Mol. Cell. 2000; 5: 435-443Abstract Full Text Full Text PDF PubMed Scopus (417) Google Scholar, 5Hofmann E.R. Milstein S. Boulton S.J. Ye M. Hofmann J.J. Stergiou L. Gartner A. Vidal M. Hengartner M.O. Caenorhabditis elegans HUS-1 is a DNA damage checkpoint protein required for genome stability and EGL-1-mediated apoptosis.Curr. Biol. 2002; 12: 1908-1918Abstract Full Text Full Text PDF PubMed Scopus (218) Google Scholar, 6Ahmed S. Alpi A. Hengartner M.O. Gartner A. C. elegans RAD-5/CLK-2 defines a new DNA damage checkpoint protein.Curr. Biol. 2001; 11: 1934-1944Abstract Full Text Full Text PDF PubMed Scopus (134) Google Scholar, 7Derry W.B. Putzke A.P. Rothman J.H. Caenorhabditis elegans p53: Role in apoptosis, meiosis, and stress resistance.Science. 2001; 294: 591-595Crossref PubMed Scopus (384) Google Scholar, 8Schumacher B. Hofmann K. Boulton S. Gartner A. The C. elegans homolog of the p53 tumor suppressor is required for DNA damage-induced apoptosis.Curr. Biol. 2001; 11: 1722-1727Abstract Full Text Full Text PDF PubMed Scopus (292) Google Scholar, 9Yuan J.Y. Horvitz H.R. The Caenorhabditis elegans genes ced-3 and ced-4 act cell autonomously to cause programmed cell death.Dev. Biol. 1990; 138: 33-41Crossref PubMed Scopus (444) Google Scholar, 10Conradt B. Horvitz H.R. The C. elegans protein EGL-1 is required for programmed cell death and interacts with the Bcl-2-like protein CED-9.Cell. 1998; 93: 519-529Abstract Full Text Full Text PDF PubMed Scopus (514) Google Scholar, 11del Peso L. González V.M. Núñez G. Caenorhabditis elegans EGL-1 disrupts the interaction of CED-9 with CED-4 and promotes CED-3 activation.J. Biol. Chem. 1998; 273: 33495-33500Crossref PubMed Scopus (88) Google Scholar, 12Chen F. Hersh B.M. Conradt B. Zhou Z. Riemer D. Gruenbaum Y. Horvitz H.R. Translocation of C. elegans CED-4 to nuclear membranes during programmed cell death.Science. 2000; 287: 1485-1489Crossref PubMed Scopus (198) Google Scholar, 13Schumacher B. Hanazawa M. Lee M.H. Nayak S. Volkmann K. Hofmann E.R. Hengartner M. Schedl T. Gartner A. Translational repression of C. elegans p53 by GLD-1 regulates DNA damage-induced apoptosis.Cell. 2005; 120: 357-368Abstract Full Text Full Text PDF PubMed Scopus (174) Google Scholar]. It has been hypothesized that the major regulatory events controlling cell death occur by cell-autonomous mechanisms, that is, within the dying cell. In support of this, genetic studies in C. elegans have shown that the core apoptosis pathway genes ced-4/APAF-1 and ced-3/caspase are required in cells fated to die [9Yuan J.Y. Horvitz H.R. The Caenorhabditis elegans genes ced-3 and ced-4 act cell autonomously to cause programmed cell death.Dev. Biol. 1990; 138: 33-41Crossref PubMed Scopus (444) Google Scholar]. However, it is not known whether the upstream signals that activate apoptosis function in a cell-autonomous manner. Here we show that kri-1, an ortholog of KRIT1/CCM1, which is mutated in the human neurovascular disease cerebral cavernous malformation [14Sahoo T. Johnson E.W. Thomas J.W. Kuehl P.M. Jones T.L. Dokken C.G. Touchman J.W. Gallione C.J. Lee-Lin S.Q. Kosofsky B. et al.Mutations in the gene encoding KRIT1, a Krev-1/rap1a binding protein, cause cerebral cavernous malformations (CCM1).Hum. Mol. Genet. 1999; 8: 2325-2333Crossref PubMed Scopus (305) Google Scholar, 15Laberge-le Couteulx S. Jung H.H. Labauge P. Houtteville J.P. Lescoat C. Cecillon M. Marechal E. Joutel A. Bach J.F. Tournier-Lasserve E. Truncating mutations in CCM1, encoding KRIT1, cause hereditary cavernous angiomas.Nat. Genet. 1999; 23: 189-193Crossref PubMed Scopus (394) Google Scholar], is required to activate DNA damage-dependent cell death independently of cep-1/p53. Interestingly, we find that kri-1 regulates cell death in a cell-nonautonomous manner, revealing a novel regulatory role for nondying cells in eliciting cell death in response to DNA damage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,156
Score d'incertitude au seuil0,774

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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