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Enregistrement W2090281724 · doi:10.1074/jbc.m112.364208

Substrate Profile and Metal-ion Selectivity of Human Divalent Metal-ion Transporter-1

2012· article· en· W2090281724 sur OpenAlexfundno aff
Anthony C Illing, Ali Shawki, Christopher L. Cunningham, Bryan Mackenzie

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCincinnati Children's Hospital Medical CenterNational Institutes of HealthU.S. Public Health ServiceNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesMcGill UniversityNational Institute of Environmental Health SciencesUniversity of Cincinnati
Mots-clésSelectivityMetalSubstrate (aquarium)DivalentInorganic chemistryChemistryTransporterDivalent metalIonMetal ions in aqueous solutionBiochemistryBiologyOrganic chemistryGeneCatalysisEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Divalent metal-ion transporter-1 (DMT1) is a H(+)-coupled metal-ion transporter that plays essential roles in iron homeostasis. DMT1 exhibits reactivity (based on evoked currents) with a broad range of metal ions; however, direct measurement of transport is lacking for many of its potential substrates. We performed a comprehensive substrate-profile analysis for human DMT1 expressed in RNA-injected Xenopus oocytes by using radiotracer assays and the continuous measurement of transport by fluorescence with the metal-sensitive PhenGreen SK fluorophore. We provide validation for the use of PhenGreen SK fluorescence quenching as a reporter of cellular metal-ion uptake. We determined metal-ion selectivity under fixed conditions using the voltage clamp. Radiotracer and continuous measurement of transport by fluorescence assays revealed that DMT1 mediates the transport of several metal ions that were ranked in selectivity by using the ratio I(max)/K(0.5) (determined from evoked currents at -70 mV): Cd(2+) > Fe(2+) > Co(2+), Mn(2+) ≫ Zn(2+), Ni(2+), VO(2+). DMT1 expression did not stimulate the transport of Cr(2+), Cr(3+), Cu(+), Cu(2+), Fe(3+), Ga(3+), Hg(2+), or VO(+). (55)Fe(2+) transport was competitively inhibited by Co(2+) and Mn(2+). Zn(2+) only weakly inhibited (55)Fe(2+) transport. Our data reveal that DMT1 selects Fe(2+) over its other physiological substrates and provides a basis for predicting the contribution of DMT1 to intestinal, nasal, and pulmonary absorption of metal ions and their cellular uptake in other tissues. Whereas DMT1 is a likely route of entry for the toxic heavy metal cadmium, and may serve the metabolism of cobalt, manganese, and vanadium, we predict that DMT1 should contribute little if at all to the absorption or uptake of zinc. The conclusion in previous reports that copper is a substrate of DMT1 is not supported.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations272
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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