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Enregistrement W2090453855 · doi:10.1097/fpc.0b013e32835001e7

Pharmacogenomic analysis of ATP-sensitive potassium channels coexpressing the common type 2 diabetes risk variants E23K and S1369A

2011· article· en· W2090453855 sur OpenAlexafffund
Veronica Lang, Mohammad Fatehi, Peter E. Light

Notice bibliographique

RevuePharmacogenetics and Genomics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Ischemia and Reperfusion
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGliclazideGlimepirideGlibenclamidePharmacologyHaplotypeTolbutamideSulfonylureaGlipizideChemistryInternal medicineBiologyEndocrinologyType 2 diabetesDiabetes mellitusMedicineBiochemistryGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: The common ATP-sensitive potassium (KATP) channel variants E23K and S1369A, found in the KCNJ11 and ABCC8 genes, respectively, form a haplotype that is associated with an increased risk for type 2 diabetes. Our previous studies showed that KATP channel inhibition by the A-site sulfonylurea gliclazide was increased in the K23/A1369 haplotype. Therefore, we studied the pharmacogenomics of seven clinically used sulfonylureas and glinides to determine their structure-activity relationships in KATP channels containing either the E23/S1369 nonrisk or K23/A1369 risk haplotypes. RESEARCH DESIGN AND METHODS: The patch-clamp technique was used to determine sulfonylurea and glinide inhibition of recombinant human KATP channels containing either the E23/S1369 or the K23/A1369 haplotype. RESULTS: KATP channels containing the K23/A1369 risk haplotype were significantly less sensitive to inhibition by tolbutamide, chlorpropamide, and glimepiride (IC50 values for K23/A1369 vs. E23/S1369=1.15 vs. 0.71 μmol/l; 4.19 vs. 3.04 μmol/l; 4.38 vs. 2.41 nmol/l, respectively). In contrast, KATP channels containing the K23/A1369 haplotype were significantly more sensitive to inhibition by mitiglinide (IC50=9.73 vs. 28.19 nmol/l for K23/A1369 vs. E23/S1369) and gliclazide. Nateglinide, glipizide, and glibenclamide showed similar inhibitory profiles in KATP channels containing either haplotype. CONCLUSION: Our results demonstrate that the ring-fused pyrrole moiety in several A-site drugs likely underlies the observed inhibitory potency of these drugs on KATP channels containing the K23/A1369 risk haplotype. It may therefore be possible to tailor existing therapy or design novel drugs that display an increased efficacy in type 2 diabetes patients homozygous for these common KATP channel haplotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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