MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2090531462 · doi:10.1139/w02-071

Potato-associated bacteria and their antagonistic potential towards plant-pathogenic fungi and the plant-parasitic nematode<i>Meloidogyne incognita</i>(Kofoid &amp; White) Chitwood

2002· article· en· W2090531462 sur OpenAlexvenueno aff
A. Krechel, A. Faupel, Johannes Hallmann, Andreas Ulrich, Gabriele Berg

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésBiologyPhyllosphereRhizosphereTerra incognitaMeloidogyne incognitaRhizoctonia solaniBacteriaBotanyNematodeMicrobiologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To study the effect of microenvironments on potato-associated bacteria, the abundance and diversity of bacteria isolated from the rhizosphere, phyllosphere, endorhiza, and endosphere of field grown potato was analyzed. Culturable bacteria were obtained after plating on R2A medium. The endophytic populations averaged 10(3) and 10(5) CFU/g (fresh wt.) for the endosphere and endorhiza. respectively, which were lower than those for the ectophytic microenvironments, with 10(5) and 10(7) CFU/g (fresh wt.) for the phyllosphere and rhizosphere, respectively. The composition and richness of bacterial species was microenvironment-dependent. The occurrence and diversity of potato-associated bacteria was additionally monitored by a cultivation-independent approach using terminal restriction fragment length polymorphism analysis of 16S rDNA. The patterns obtained revealed a high heterogeneity of community composition and suggested the existence of microenvironment-specific communities. In an approach to measure the antagonistic potential of potato-associated bacteria, a total of 440 bacteria was screened by dual testing for in vitro antagonism towards the soilborne pathogens Verticillium dahliae and Rhizoctonia solani. The proportion of isolates with antagonistic activity was highest for the rhizosphere (10%), followed by the endorhiza (9%), phyllosphere (6%), and endosphere (5%). All 33 fungal antagonists were characterized by testing their in vitro antagonistic mechanisms, including their glucanolytic, chitinolytic, pectinolytic, cellulolytic, and proteolytic activity, and by their BOX-PCR fingerprints. In addition, they were screened for their biocontrol activity against Meloidogyne incognita. Overall, nine isolates belonging to Pseudomonas and Streptomyces species were found to control both fungal pathogens and M. incognita and were therefore considered as promising biological control agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,173
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations191
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of MicrobiologyMême sujetNematode management and characterization studiesTravaux en français237 207