MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2090542683 · doi:10.1139/o08-131

The multiple facets of histone H4-lysine 20 methylationThis paper is one of a selection of papers published in this Special Issue, entitled CSBMCB’s 51st Annual Meeting – Epigenetics and Chromatin Dynamics, and has undergone the Journal’s usual peer review process.

2009· review· en· W2090542683 sur OpenAlexvenueno aff
Hongbo Yang, Craig A. Mizzen

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2009
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen Forschung
Mots-clésSelection (genetic algorithm)EpigeneticsChromatinHistone H4LysineHistoneBiologyEvolutionary biologyCell biologyComputational biologyComputer scienceGeneticsArtificial intelligenceDNAAmino acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antisera raised against individual sites of histone post-translational modification (PTM) have provided critical insights into the biology of many of these PTMs. However, limitations inherent to immunochemical approaches can skew results obtained with these reagents, possibly leading investigators to misjudge the role of a specific histone PTM in a given process. We have used mass spectrometry in conjunction with cell synchronization, metabolic labeling, RNA interference, and other approaches to show that the SET domain proteins PR-Set7 and Suv4-20 mediate progressive global mono-, di-, and trimethylation of lysine 20 (K20) in newly synthesized histone H4, beginning approximately at the G2/M transition, well after new H4 is deposited in replicating chromatin during S phase. Immunochemical and other approaches have implicated H4-K20 methylation in multiple processes, including gene activation, gene repression, chromatin condensation, S phase progression, mitosis, and DNA-damage checkpoint signaling. Here, we review recent data on the regulation and significance of K20 methylation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiochemistry and Cell BiologyMême sujetEpigenetics and DNA MethylationTravaux en français237 207