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Enregistrement W2090610744 · doi:10.1007/s10096-013-1987-5

Association between susceptibility to photodynamic oxidation and the genetic background of Staphylococcus aureus

2013· article· en· W2090610744 sur OpenAlexaff
Aleksandra Rapacka-Zdończyk, Anders Rhod Larsen, Joanna Empel, Ankita Patel, Mariusz Grinholc

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePhotodynamic Therapy Research Studies
Établissements canadiensSt. Thomas Hospital
Organismes subventionnairesUniversidad de Oviedo
Mots-clésStaphylococcus aureusPhotodynamic therapyMicrobiologyBiologySCCmecPhotosensitizerPopulationMethicillin-resistant Staphylococcus aureusGeneticsMedicineChemistryBacteriaPhotochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multidrug resistant strains of Staphylococcus aureus are a major cause of skin and soft tissue infections requiring the development of novel and alternative therapeutic options. Photodynamic oxidation is the cornerstone of antimicrobial photodynamic therapy (aPDT) involving the combined use of light and a photosensitizer, which, in the presence of oxygen, originates cytotoxic species capable of oxidizing biological molecules and leads to inactivation of target cells. We have previously shown that susceptibility to aPDT differs significantly across S. aureus isolates and could be associated with several genetic elements. However, the effect of the photodynamic process regarding the S. aureus genetic background has never been reported. We have compared the genetic backgrounds of the strains (SCCmec types, spa types and main clonal complexes) with respect to their susceptibility to protoporphyrin IX-mediated photodynamic inactivation. SCCmec typing revealed no differences in response to photoinactivation. However, detection of spa types and clonal complexes clustered the studied population of MRSA strains according to their response to photodynamic oxidation. Clonal complex 1 (CC1) accounted for elevated resistance and CC30 (ST36) for susceptibility to photoinactivation. Moreover, spa typing identified isolates resistant (t032) and susceptible to photodynamic oxidation (t051, t015). The very tight association between clonal lineages and response to photodynamic inactivation indicates the important role of genetic background for aPDT efficacy. These results make a case for the development of a diagnostic tool with the predictive value of aPDT efficacy according to an identified genetic background of S. aureus isolates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,123
Score d'incertitude au seuil0,409

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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