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Enregistrement W2090614925 · doi:10.1039/c4ob01399a

Influence of B-ring modifications on proton affinity, transmembrane anion transport and anti-cancer properties of synthetic prodigiosenes

2014· article· en· W2090614925 sur OpenAlexafffund
Estelle Marchal, Soumya Rastogi, Alison Thompson, Jeffery T. Davis

Notice bibliographique

RevueOrganic & Biomolecular Chemistry · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolism and Applications
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesBasic Energy SciencesCanadian Institutes of Health ResearchNova Scotia Health Research FoundationTerry Fox FoundationBeatrice Hunter Cancer Research InstituteCancer Research InstituteU.S. Department of Energy
Mots-clésChemistryRing (chemistry)Transmembrane proteinIonProtonCombinatorial chemistryProton affinityStereochemistryBiochemistryOrganic chemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prodigiosin is the parent compound of the tripyrrolic natural products known as the prodigiosenes. Some of these natural products and their synthetic analogs show anti-cancer, immunosuppressive and antimicrobial actions, amongst other biological activities. One mechanism put forth to explain their biological activity is that since prodigiosenes are typically protonated at physiological pH they can alter intracellular pH via HCl co-transport (or Cl(-)/OH(-) exchange) across cell membranes. In this study we synthesized a series of prodigiosene analogs with different -O-aryl substituents attached to the B-ring of the tripyrrolic skeleton. NMR studies showed that these analogs can exist as a mixture of two stable α and β conformers in acidic solution, and that both conformers can bind anions in solution. We found that the electronic nature of the O-aryl substituent on the B-ring influences the rate at which these prodigiosenes catalyze transmembrane anion transport, i.e. the prodigiosenes with the higher pKa had greater Cl(-)/NO3(-) exchange rates. Four of the synthetic prodigiosenes were tested for their in vitro anti-cancer activities in the NCI60 human tumour panel. Despite their promising in vitro anti-cancer activity (GI50 values ranging from 18 to 74 nM), there was no evidence that this activity is influenced by the extent of protonation of these synthetic prodigiosenes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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