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Enregistrement W2090650062 · doi:10.1177/0269881113517957

Genetic predictors of antidepressant side effects: A grouped candidate gene approach in the Genome-Based Therapeutic Drugs for Depression (GENDEP) study

2014· article· en· W2090650062 sur OpenAlexaff
Karen Hodgson, Rudolf Uher, Andrew Crawford, Glyn Lewis, Michael O‘Donovan, Robert Keers, Mojca Zvezdana Dernovšek, Ole Mors, Joanna Hauser, Daniel Souery, Wolfgang Maier, Neven Henigsberg, Marcella Rietschel, Anna Placentino, Katherine J. Aitchison, Anne Farmer, Oliver S. P. Davis, Peter McGuffin

Notice bibliographique

RevueJournal of Psychopharmacology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurotransmitter Receptor Influence on Behavior
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesLundbeckfondenMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésAntidepressantDepression (economics)Candidate geneGenome-wide association studyPsychiatryPsychologyMedicineGenePharmacologyGeneticsSingle-nucleotide polymorphismBiologyGenotypeAnxiety

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The unwanted side effects associated with antidepressants are key determinants of treatment adherence in depression; propensity to experience these adverse drug reactions (ADRs) may be influenced by genetic variation. However, previous work attempting to ascertain the genetic variants involved has had limited success, in part due to the range of ADRs reported with antidepressants. METHOD: ADRs reported with antidepressant treatment were categorised using their likely pharmacological basis; adrenergic, cholinergic, serotonergic and histaminergic. To identify genetic predictors of susceptibility to each group of ADRs, a candidate gene analysis was performed with data from 431 depressed patients (from a total sample size of 811 patients) enrolled in the Genome-Based Therapeutic Drugs for Depression (GENDEP) project, who were randomly allocated to receive treatment with escitalopram or nortriptyline. Data from 474 patients treated with citalopram or reboxetine in the GenPod project (total sample of 601 patients) were used for replication of significant findings. RESULTS: We found no significant predictors of presumed adrenergic, cholinergic and histaminergic ADRs. Putative serotonergic ADRs were significantly associated with variation in the gene encoding the serotonin 2C receptor (HTR2C, rs6644093, odds ratio (OR)=1.72, 95% confidence interval (CI)=1.31-2.25, p=7.43×10(-5)) in GENDEP. However, this finding was not replicated in GenPod. CONCLUSIONS: The association between serotonergic side effects and variation in the HTR2C gene in the GENDEP sample supports the hypothesis that serotonin receptor-mediated mechanisms underlie these adverse reactions, however this finding was not replicated in GenPod.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,609
Score d'incertitude au seuil0,750

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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