MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2090839913 · doi:10.1242/jeb.01551

Cytoplasmic carbonic anhydrase isozymes in rainbow trout<i>Oncorhynchus mykiss</i>: comparative physiology and molecular evolution

2005· article· en· W2090839913 sur OpenAlexaff
Andrew J. Esbaugh, Steve F. Perry, M. Bayaa, T. Georgalis, James G. Nickerson, Bruce L. Tufts, K. M. Gilmour

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme function and inhibition
Établissements canadiensCarleton UniversityUniversity of OttawaQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIsozymeCarbonic anhydraseRainbow troutGillCytoplasmGene isoformBiologyTroutBiochemistryAcetazolamideMolecular biologyEnzymeZoologyGeneFish <Actinopterygii>PhysiologyFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It is well established that the gills of teleost fish contain substantial levels of cytoplasmic carbonic anhydrase (CA), but it is unclear which CA isozyme(s) might be responsible for this activity. The objective of the current study was to determine if branchial CA activity in rainbow trout was the result of a general cytoplasmic CA isozyme, with kinetic properties, tissue distribution and physiological functions distinct from those of the red blood cell (rbc)-specific CA isozyme. Isolation and sequencing of a second trout cytoplasmic CA yielded a 780 bp coding region that was 76% identical with the trout rbc CA (TCAb), although the active sites differed by only 1 amino acid. Interestingly, phylogenetic analyses did not group these two isozymes closely together, suggesting that more fish species may have multiple cytoplasmic CA isozymes. In contrast to TCAb, the second cytoplasmic CA isozyme had a wide tissue distribution with high expression in the gills and brain, and lower expression in many tissues, including the red blood cells. Thus, unlike TCAb, the second isozyme lacks tissue specificity and may be expressed in the cytoplasm of all cells. For this reason, it is referred to hereafter as TCAc (trout cytoplasmic CA). The inhibitor properties of both cytoplasmic isozymes were similar (Ki acetazolamide 1.21+/-0.18 nmol l(-1) and 1.34+/-0.10 nmol l(-1) for TCAc and TCAb, respectively). However, the turnover of TCAb was over three times greater than that of TCAc (30.3+/-5.83 vs 8.90+/-1.95 e4 s(-1), respectively), indicating that the rbc-specific CA isoform was significantly faster than the general cytoplasmic isoform. Induction of anaemia revealed differential expression of the two isozymes in the red blood cell; whereas TCAc mRNA expression was unaffected, TCAb mRNA expression was significantly increased by 30- to 60-fold in anaemic trout.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Experimental BiologyMême sujetEnzyme function and inhibitionTravaux en français237 207