Gene Expression Profile of Herpesvirus-Infected T Cells Obtained Using Immunomicroarrays: Induction of Proinflammatory Mechanisms
Notice bibliographique
Résumé
Herpesvirus infections can frequently lead to acute inflammation, yet the mechanisms regulating this event remain poorly understood. In order to determine some of the immunological mechanisms regulated by human herpesvirus infections, we studied the gene expression profile of lymphocytes infected with human herpesvirus 6 (HHV-6) by using a novel immunomicroarray. Our nylon-based immunomicroarray contained more than 1,150 immune response-related genes and was highly consistent between experiments. Experimentally, we found that independently of the HHV-6 strain used to infect T cells, multiple proinflammatory genes were increased and anti-inflammatory genes were decreased at the mRNA and protein levels. HHV-6 strains A and B increased expression of the genes for interleukin-18 (IL-18), the IL-2 receptor, members of the tumor necrosis factor alpha superfamily receptors, mitogen-activated protein kinase, and Janus kinase signaling proteins. As reported previously, CD4 protein levels were also increased significantly. Specific type 2 cytokines, including IL-10, its receptor, and IL-14, were downregulated by HHV-6 infection and, interestingly, amyloid precursor proteins and type 1 and 2 presenilins. Thus, T cells respond to HHV-6 infection by inducing a type 1 immune response that may play a significant role in the development and progression of diseases associated with HHV-6, including pediatric, hematologic, transplant, and neurologic disorders.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».