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Enregistrement W2090943753 · doi:10.1210/me.2005-0221

Hepatocyte Nuclear Factor-3α Binding at P Sequences of the Human Growth Hormone Locus Is Associated with Pituitary Repressor Function

2005· article· en· W2090943753 sur OpenAlexafffund
Lisa Norquay, Xiaoyang Yang, Yan Jin, Karen A. Detillieux, Peter A. Cattini

Notice bibliographique

RevueMolecular Endocrinology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGrowth Hormone and Insulin-like Growth Factors
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyChromatin immunoprecipitationRepressorTranscription factorHepatocyte nuclear factorsHepatocyte nuclear factor 4Molecular biologyLocus (genetics)Regulatory sequenceGenePromoterGeneticsGene expressionNuclear receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human GH family consists of five genes, including the placental chorionic somatomammotropins (CS), within a single locus on chromosome 17. Based on nuclease sensitivity, the entire GH/CS locus is accessible in pituitary chromatin, yet only GH-N is expressed. Previously, we reported a P sequence element (263P) capable of repressing placental CS-A promoter activity in transfected pituitary (GC) cells, and our data indicated a possible role for nuclear factor-1 (NF-1) and regulatory factor X1 in this repression. In this study we show the formation of two independent pituitary complexes in vitro: a repressor complex containing NF-1 and a nonfunctional complex containing regulatory factor X1. In vitro repressor function is stabilized by the presence of P sequence element C (PSE-C), downstream of the previously characterized PSE-A and PSE-B. Repressor function is also dependent on an intact Pit-1 binding site in the CS-A promoter. EMSAs with PSE-C reveal binding of the hepatocyte nuclear factor-3/forkhead (HNF-3/fkh) family of transcription factors in rat pituitary GC cells. This observation is extended to human pituitary tissue, where HNF-3alpha's association with P sequences is confirmed by chromatin immunoprecipitation. Furthermore, protein-protein interactions between HNF-3alpha and NF-1 family members are demonstrated. These results identify HNF-3alpha as an additional member of the pituitary P sequence regulatory complex, implicating it in tissue-specific expression of the human GH/CS family.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,152
Score d'incertitude au seuil0,929

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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