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Enregistrement W2090991004 · doi:10.1158/1538-7445.am2014-sy09-03

Abstract SY09-03: How deregulation of histone methyltransferases drive malignant transformation of B-cells

2014· article· en· W2090991004 sur OpenAlexaff
Wendy Béguelin, Matt Teater, Relja Popovic, Yanwen Jiang, Leandro Cerchietti, Rita Shaknovich, Randy D. Gascoyne, Ross L. Levine, Omar Abdel‐Wahab, Jonathan D. Licht, Olivier Elemento, Ari Melnick

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEZH2BiologyMethyltransferaseEpigeneticsGerminal centerHistone methyltransferaseCancer researchDNA methylationMalignant transformationChromatinCarcinogenesisB cellHistoneMethylationGeneGeneticsGene expressionAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Diffuse Large B-cell Lymphomas (DLBCLs) are a heterogeneous group of diseases initiating from germinal center (GC) B cells. GC B cells are uniquely specialized to tolerate rapid proliferation, and physiological genomic instability in order to generate a diverse set of clones of cells encoding high affinity antibodies. This accelerated micro-evolutionary process requires the concerted action of transcription and epigenetic factors that collectively reprogram B cells to overcome many of their normal checkpoint restraints and tolerate the various stresses associated with affinity maturation. The GC phenotype poses a significant risk of malignant transformation to B cells, which must accordingly balance suppression of checkpoints with suppression of pro-oncogenic genes. Epigenetic regulatory complexes play a critical role in lymphomagenesis. EZH2, which epigenetically silences genes through histone 3 lysine 27 methylation is upregulated in normal and malignant GC B cells. EZH2 is often affected by gain of function mutations in lymphomas that alter its enzymatic specificity. EZH2 mediates GC formation by transiently suppressing checkpoint genes and terminal differentiation genes through formation of bivalent chromatin domains. EZH2 somatic mutations induce germinal center hyperplasia and malignant transformation, and cooperate with other oncogenes such as BCL2. EZH2 specific inhibitors can suppress the growth of GC derived lymphoma cells in vitro and in vivo, and are currently being evaluated in early phase clinical trials. DNA methyltransferase 1 (DNMT1) is required for B cells to form GCs, and GC B cells display cytosine methylation redistribution as compared to resting or naïve B cells. DLBCLs in turn exhibit prominent and heterogeneous disruption of cytosine methylation distribution, with specific and distinct DNA methylation profiles occurring in different lymphoma subtypes. Epigenetic heterogeneity is associated with unfavorable outcome in B-cell lymphomas, suggesting that epigenetic diversity may provide a survival advantage to lymphoma cell populations. DNA methyltransferase inhibitors can reprogram lymphoma cells to develop a form of incomplete senescence that sensitizes lymphoma cells to more readily respond to chemotherapy. DNA methyltransferase inhibitors can be safely combined with standard lymphoma therapies for the up-front treatment of patients with high-risk lymphomas. Citation Format: Wendy Beguelin, Matt Teater, Relja Popovic, Yanwen Jiang, Leandro Cerchietti, Rita Shaknovich, Randy Gascoyne, Ross Levine, Omar Abdel-Wahab, Jonathan Licht, Olivier Elemento, Ari M. Melnick. How deregulation of histone methyltransferases drive malignant transformation of B-cells. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr SY09-03. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-SY09-03

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,338 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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