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Enregistrement W2091100031 · doi:10.1086/510391

A Portrait of the Geographic Dissemination of the Clostridium difficile North American Pulsed-Field Type 1 Strain and the Epidemiology of C. difficile-Associated Disease in Quebec

2006· article· en· W2091100031 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensJewish General HospitalHôpital Maisonneuve-RosemontMcGill University Health CentreHôpital Saint-LucCentre Hospitalier de l’Université de MontréalUniversité de MontréalInstitut National de Santé Publique du Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPulsed-field gel electrophoresisClostridium difficileMicrobiologyClostridium difficile toxin ATypingMolecular epidemiologyMedicineIncidence (geometry)VirulenceMultilocus sequence typingVirologyBiologyAntibioticsGenotypeGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: An increase in the incidence and severity of Clostridium difficile-associated disease in Québec and the United States has been associated with a hypervirulent strain referred to as North American pulsed-field type 1 (NAP1)/027. METHODS: In 2005, a prospective study was conducted in 88 Québec hospitals, and 478 consecutive nosocomial isolates of C. difficile were obtained. The isolates were subjected to pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) typing, antimicrobial susceptibility testing, and detection of binary toxin genes and tcdC gene deletion. Data on patient age and occurrence of complications were collected. RESULTS: PFGE typing of 478 isolates of C. difficile yielded 61 PFGE profiles. Pulsovars A (57%), B (10%), and B1 (8%) were predominant. The PFGE profile of pulsovar A was identical to that of strain NAP1. It showed 67% relatedness with 15 other PFGE patterns, among which 11 had both binary toxin genes and a partial tcdC deletion but different antibiotic susceptibility profiles. Pulsovars B and B1 were identical to strain NAP2/ribotype 001. In hospitals showing a predominant clonal A or B-B1 PFGE pattern, incidence of C. difficile-associated disease was 2 and 1.3 times higher, respectively, than in hospitals without any predominant clonal PFGE pattern. Severe disease was twice as frequent among patients with strains possessing binary toxin genes and tcdC deletion than among patients with strains lacking these virulence factors. CONCLUSIONS: This study helped to quantify the impact of strain NAP1 on the incidence and severity of C. difficile-associated disease in Québec in 2005. The identification of the geographic dissemination of this predominant strain may help to focus regional infection-control efforts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,020
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,020
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,317 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle