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Enregistrement W2091104811 · doi:10.1097/fpc.0000000000000026

Novel CYP2A6 variants identified in African Americans are associated with slow nicotine metabolism in vitro and in vivo

2013· article· en· W2091104811 sur OpenAlex
Mark Piliguian, Andy Z. X. Zhu, Qian Zhou, Neal L. Benowitz, Jasjit S. Ahluwalia, Lisa Sanderson Cox, Rachel F. Tyndale

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePharmacogenetics and Genomics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNicotinic Acetylcholine Receptors Study
Établissements canadiensUniversity of TorontoCanada Research ChairsCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institute on Drug AbuseCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCYP2A6NicotineCotinineBiologyIn vivoGeneticsMetabolismPharmacologyEndocrinologyCytochrome P450CYP3A4

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Nicotine, the main addictive ingredient in tobacco, is metabolically inactivated to cotinine primarily by the hepatic enzyme CYP2A6. Considerable genetic variation in the CYP2A6 gene results in large variation in the rates of nicotine metabolism, which in turn alters smoking behaviours (e.g. amount of cigarettes smoked, risk for dependence and success in smoking cessation). The aim of this study was to identify and characterize novel variants in CYP2A6. MATERIALS AND METHODS: The CYP2A6 gene from African American phenotypically slow nicotine metabolizers was sequenced and seven novel variants were identified [CYP2A6*39 (V68M), CYP2A6*40 (I149M), CYP2A6*41 (R265Q), CYP2A6*42 (I268T), CYP2A6*43 (T303I), CYP2A6*44 (E390K), CYP2A6*44 (L462P)]. Variants were introduced into a bi-cistronic cDNA expression construct containing CYP2A6 and P450 oxidoreductase and assessed for protein expression, enzymatic activity and stability as evaluated using western blotting and nicotine metabolism. Genotyping assays were developed and allelic frequencies were assessed in 534 African Americans. RESULTS: The variants showed significantly lower protein expression (P<0.001) when compared with the wild-type as well as reduced metabolism of nicotine to cotinine when controlling for cDNA expression using P450 oxidoreductase (P<0.001). The variants also showed reduced stability at 37°C. Allelic frequencies ranged from 0.1 to 0.6% with a collective genotype frequency of 3.2%; the impact in vitro correlated significantly with in-vivo activity (R(2)=0.40-0.48, P<0.05). Together, those with a novel variant had significantly lower nicotine metabolism in vivo than those without genetic variants (P<0.01). CONCLUSION: Here, we identified a number of novel variants with reduced/loss of CYP2A6 activity, increasing our understanding of CYP2A6 genetic variability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,238
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle