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Enregistrement W2091127440 · doi:10.3390/biology2010356

The Effect of Freeze-Thaw Conditions on Arctic Soil Bacterial Communities

2013· article· en· W2091127440 sur OpenAlexaffabout
Niraj Kumar, Paul Grogan, Haiyan Chu, Casper T. Christiansen, Virginia K. Walker

Notice bibliographique

RevueBiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueClimate change and permafrost
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPermafrostArcticBiologyBayEcologySoil waterMicrobial population biologyEcosystemFjordArctic vegetationOceanographyTundraBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Climate change is already altering the landscape at high latitudes. Permafrost is thawing, the growing season is starting earlier, and, as a result, certain regions in the Arctic may be subjected to an increased incidence of freeze-thaw events. The potential release of carbon and nutrients from soil microbial cells that have been lysed by freeze-thaw transitions could have significant impacts on the overall carbon balance of arctic ecosystems, and therefore on atmospheric CO2 concentrations. However, the impact of repeated freezing and thawing with the consequent growth and recrystallization of ice on microbial communities is still not well understood. Soil samples from three distinct sites, representing Canadian geographical low arctic, mid-arctic and high arctic soils were collected from Daring Lake, Alexandra Fjord and Cambridge Bay sampling sites, respectively. Laboratory-based experiments subjected the soils to multiple freeze-thaw cycles for 14 days based on field observations (0 °C to -10 °C for 12 h and -10 °C to 0 °C for 12 h) and the impact on the communities was assessed by phospholipid fatty acid (PLFA) methyl ester analysis and 16S ribosomal RNA gene sequencing. Both data sets indicated differences in composition and relative abundance between the three sites, as expected. However, there was also a strong variation within the two high latitude sites in the effects of the freeze-thaw treatment on individual PLFA and 16S-based phylotypes. These site-based heterogeneities suggest that the impact of climate change on soil microbial communities may not be predictable a priori; minor differential susceptibilities to freeze-thaw stress could lead to a "butterfly effect" as described by chaos theory, resulting in subsequent substantive differences in microbial assemblages. This perspectives article suggests that this is an unwelcome finding since it will make future predictions for the impact of on-going climate change on soil microbial communities in arctic regions all but impossible.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil0,098

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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