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Enregistrement W2091208642 · doi:10.1016/j.molimm.2013.05.237

Review of phosphocholine substituents on bacterial pathogen glycans: Synthesis, structures and interactions with host proteins

2013· review· en· W2091208642 sur OpenAlexaff
N. Martin Young, Simon J. Foote, Warren W. Wakarchuk

Notice bibliographique

RevueMolecular Immunology · 2013
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensToronto Metropolitan UniversityNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhosphocholineGlycanCHOPPathogenHost (biology)BiologyInnate immune systemImmune systemGlycoproteinImmunologyBiochemistryGeneticsLymphoma

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Among the non-carbohydrate components of glycans, the addition of phosphocholine (ChoP) to the glycans of pathogens occurs more rarely than acetylation or methylation, but it has far more potent biological consequences. These arise from ChoP's multiple interactions with host proteins, which are important at all stages of the infection process. These stages include initial adherence to cells, encountering the host's innate immune system and then the adaptive immune system. Thus, in the initial stages of an infection, ChoP groups are an asset to the pathogen, but they can turn into a disadvantage subsequently. In this review, we have focussed on structural aspects of these phenomena. We describe the biosynthesis of the ChoP modification, the structures of the pathogen glycans known to carry ChoP groups and the host proteins that recognize ChoP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,940
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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