Nonclassical Regulation of Transcription: Interchromosomal Interactions at the <i>Malic enzyme</i> Locus of <i>Drosophila melanogaster</i>
Notice bibliographique
Résumé
Regulation of transcription can be a complex process in which many cis- and trans-interactions determine the final pattern of expression. Among these interactions are trans-interactions mediated by the pairing of homologous chromosomes. These trans-effects are wide ranging, affecting gene regulation in many species and creating complex possibilities in gene regulation. Here we describe a novel case of trans-interaction between alleles of the Malic enzyme (Men) locus in Drosophila melanogaster that results in allele-specific, non-additive gene expression. Using both empirical biochemical and predictive bioinformatic approaches, we show that the regulatory elements of one allele are capable of interacting in trans with, and modifying the expression of, the second allele. Furthermore, we show that nonlocal factors--different genetic backgrounds--are capable of significant interactions with individual Men alleles, suggesting that these trans-effects can be modified by both locally and distantly acting elements. In sum, these results emphasize the complexity of gene regulation and the need to understand both small- and large-scale interactions as more complete models of the role of trans-interactions in gene regulation are developed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».