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Enregistrement W2091389780 · doi:10.1177/1098612x13475465

Preliminary evaluation of a quantitative polymerase chain reaction assay for diagnosis of feline immunodeficiency virus infection

2013· article· en· W2091389780 sur OpenAlexaff
Mélanie Ammersbach, Susan E. Little, Dorothee Bienzle

Notice bibliographique

RevueJournal of Feline Medicine and Surgery · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensBytown Cat HospitalUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFeline immunodeficiency virusCATSVirologyVaccinationGold standard (test)AntibodyPolymerase chain reactionReal-time polymerase chain reactionBiologyVirusMedicineLentivirusImmunologyViral diseaseGeneInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) has high sensitivity and specificity for detection of feline immunodeficiency virus (FIV) antibodies, but does not distinguish between infection and vaccination. Real-time quantitative PCR (qPCR) assays may distinguish infected from vaccinated cats. Performance of a commercial qPCR assay was assessed with blood samples from 29 FIV-infected non-vaccinated, 26 FIV-uninfected vaccinated and 35 FIV-uninfected non-vaccinated cats. FIV infection status of cats was assigned based on a combination of vaccination and medical history, prevention of contact with potentially infected cats and two FIV antibody ELISA results. Test sensitivity and specificity were determined against this gold standard. The qPCR test yielded positive results in samples from 23/29 FIV-infected non-vaccinated, 2/26 FIV-uninfected vaccinated and 0/35 FIV-uninfected non-vaccinated cats. It was concluded that the qPCR test was moderately sensitive and highly specific for the diagnosis of FIV infection, and that it may be suitable for ruling out FIV infection in cats with a positive antibody ELISA result and unknown vaccination history.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,047

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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