Lipopolysaccharide induces a stromal–epithelial signalling axis in a rat model of chronic periodontitis
Notice bibliographique
Résumé
AIM: Lipopolysaccharide is a bacterial virulence factor implicated in chronic periodontitis, which may penetrate the junctional epithelial barrier and basement membrane to insult underlying stroma. We sought to identify lipopolysaccharide-induced global gene expression changes responsible for signalling between stroma and epithelium during disease onset. MATERIALS AND METHODS: Using a rat lipopolysaccharide periodontitis model, junctional epithelium and underlying stromal tissue were separately collected from healthy and diseased animals by laser-capture microdissection and subject to gene expression microarray analysis. Key gene products identified were validated in gingival epithelial and fibroblast cell cultures. RESULTS: Global gene expression patterns distinguishing health versus disease were found in and between both tissue types. In stroma, the most significantly altered gene ontology function group (Z ≥ 4.00) was cytokines, containing most significantly (±2-fold; p < 0.05) upregulated genes amphiregulin, IL1-β and Fas ligand, all positive, diffusible modulators of the epithelial growth factor receptor pathway. In epithelium, the most significant changes were in downregulated FOS-related antigen-1 gene, somatostatin receptor-2 gene and mucin-4 gene, all negative modulators of the epithelial growth factor receptor pathway. CONCLUSION: These results establish a periodontitis model for studying gene product interactions and suggests that the onset of junctional epithelial disease hyperproliferation involves a concerted stromal-epithelial signalling axis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».