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Enregistrement W2091441842 · doi:10.1111/j.1399-0004.2009.01277.x

The contribution of founder mutations to early‐onset breast cancer in French‐Canadian women

2009· article· en· W2091441842 sur OpenAlexaffabout
P Ghadirian, A. Robidoux, Ping Zhang, Robert E. Royer, Mohammad R. Akbari, S Zhang, Eve Fafard, Maurício Magalhães Costa, G. Martin, Claude Potvin, Érica Patocskai, Nicole Larouche, Rami Younan, Edgard Nassif, Sylvie Giroux, SA Narod, François Rousseau, William D. Foulkes

Notice bibliographique

RevueClinical Genetics · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensWomen's College HospitalUniversity of TorontoUniversité LavalUniversité de MontréalHôtel-Dieu de MontréalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerFounder effectGeneticsCancerMedicineMutationOncologyBiologyGeneAlleleHaplotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In an ethnically-homogeneous population, it is valuable to identify founder mutations in cancer-predisposing genes. Founder mutations have been found in four breast-cancer-predisposing genes in French-Canadian breast cancer families. The frequencies of the mutant alleles have been measured neither in a large series of unselected breast cancer patients from Quebec, nor in healthy controls. These estimates are necessary to measure their contribution to the hereditary burden of breast cancer in Quebec and to help develop genetic screening policies which are appropriate for the province. We studied 564 French-Canadian women with early-onset invasive breast cancer who were treated at a single Montreal hospital. Patients had been diagnosed at age 50 or less, and were ascertained between 2004 and 2008. We screened all 564 patients for nine founder mutations: four in BRCA1, three in BRCA2 and one each in PALB2 and CHEK2. We also studied 6433 DNA samples from newborn infants from the Quebec City area to estimate the frequency of the nine variant alleles in the French-Canadian population. We identified a mutation in 36 of the 564 breast cancer cases (6.4%) and in 35 of 6443 controls (0.5%). In the breast cancer patients, the majority of mutations were in BRCA2 (54%). However, in the general population (newborn infants), the majority of mutations were in CHEK2 (54%). The odds ratio for breast cancer to age 50, given a BRCA1 mutation, was 10.1 (95% CI: 3.7-28) and given a BRCA2 mutation was 29.5 (95% CI: 12.9-67). The odds ratio for breast cancer to age 50, given a CHEK2 mutation, was 3.6 (95% CI: 1.4-9.1). One-half of the women with a mutation had a first- or second-degree relative diagnosed with breast or ovarian cancer. Thus, it can be concluded that a predisposing mutation in BRCA1, BRCA2, CHEK2 or PALB2 is present in approximately 6% of French-Canadian women with early-onset breast cancer. It is reasonable to offer screening for founder mutations to all French-Canadian women with breast cancer before age 50. The frequency of these mutations in the general population (0.5%) is too low to advocate population-based screening.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,260
Score d'incertitude au seuil0,980

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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