A Three-dimensional Finite Element Model for the Mechanics of Cell-Cell Interactions
Notice bibliographique
Résumé
Technical challenges, including significant ones associated with cell rearrangement, have hampered the development of three-dimensional finite element models for the mechanics of embryonic cells. These challenges have been overcome by a new formulation in which the contents of each cell, assumed to have a viscosity mu, are modeled using a system of orthogonal dashpots. This approach overcomes a stiffening artifact that affects more traditional models, in which space-filling viscous elements are used to model the cytoplasm. Cells are assumed to be polyhedral in geometry, and each n-sided polygonal face is subdivided into n triangles with a common node at the face center so that it needs not remain flat. A constant tension gamma is assumed to act along each cell-cell interface, and cell rearrangements occur through one of two complementary topological transformations. The formulation predicts mechanical interactions between pairs of similar or dissimilar cells that are consistent with experiments, two-dimensional simulations, contact angle theory, and intracellular pressure calculations. Simulations of the partial engulfment of one tissue type by another show that the formulation is able to model aggregates of several hundred cells without difficulty. Simulations carried out using this formulation suggest new experimental approaches for measuring cell surface tensions and interfacial tensions. The formulation holds promise as a tool for gaining insight into the mechanics of isolated or aggregated embryonic cells and for the design and interpretation of experiments that involve them.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».