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Enregistrement W2091579844 · doi:10.1104/pp.106.086561

CO2 Sensing at Ocean Surface Mediated by cAMP in a Marine Diatom

2006· article· en· W2091579844 sur OpenAlexfundno aff
Hisashi Harada, Kensuke Nakajima, Kunihiro Sakaue, Yusuke Matsuda

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineEnergy
ThématiqueAlgal biology and biofuel production
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyYork UniversitySalt Science Research Foundation
Mots-clésPhaeodactylum tricornutumReporter geneDerepressionBiologyPromoterGeneBiochemistryCell biologyPsychological repressionChemistryMolecular biologyGene expressionDiatomBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Marine diatoms are known to be responsible for about a quarter of global primary production and their photosynthesis is sustained by inorganic carbon-concentrating mechanisms and/or C(4) metabolism. Activities of the inorganic carbon-concentrating mechanism are attenuated under enriched [CO(2)]; however, impacts of this factor on primary productivity and the molecular mechanisms of CO(2) responses in marine diatoms are unknown. In this study, transgenic cells were generated of the marine diatom Phaeodactylum tricornutum by the introduction of a beta-glucuronidase reporter gene under the control of an intrinsic CO(2)-responsive promoter, which is the sequence between -80 to +61 relative to the transcription start site of a chloroplastic-carbonic anhydrase gene, ptca1, obtained from P. tricornutum. The activity of the ptca1 promoter was effectively repressed in air-level CO(2) by treating cells with a 1.0 mm cAMP analog, dibutyryl cAMP, or a cAMP phosphodiesterase inhibitor, 3-isobutyl-1-methylxanthine. Deletion of the intrinsic cAMP-response element from the ptca1 promoter caused a lack of repression of the reporter gene uidA, even under elevated [CO(2)] and a null phenotype to the strong repressive effects of dibutyryl cAMP and 3-isobutyl-1-methylxanthine on the ptca1 promoter. Deletion of the cAMP-response element was also shown to cause derepression of the uidA reporter gene in the dark. These results indicate that the cytosolic cAMP level increases under elevated [CO(2)] and represses the ptca1 promoter. This strongly suggests the participation of cAMP metabolism, presumably at the cytosolic level, in controlling CO(2)-acquisition systems under elevated [CO(2)] at the ocean surface in a marine diatom.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,578
Score d'incertitude au seuil0,637

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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